RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617958.4

CPEB1-215, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CPEB1, Length 2,776 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CPEB1-215	ENST00000617958	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	ZNF33A	Q06730	810 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	ARSK	Q6UWY0	536 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	AHSA2	Q719I0	299 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	DET1	Q7L5Y6	550 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	ISCA2	Q86U28	154 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	TEKT5	Q96M29	485 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	COPS4	Q9BT78	406 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	SPNS1	Q9H2V7	528 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958		A0A0B4J293	547 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958		E5RI56	91 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	GSTA4	O15217	222 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	CDK1	P06493	297 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	PFKL	P17858	780 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	TNNI3	P19429	210 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	NFKB1	P19838	968 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	ALAS2	P22557	587 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	RGS6	P49758	472 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	ARHGDIA	P52565	204 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	AIF1	P55008	147 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	UFM1	P61960	85 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	PCDH1	Q08174	1060 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	QPRT	Q15274	297 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	STK11	Q15831	433 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	GPAT4	Q86UL3	456 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	TTC29	Q8NA56	475 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	FBXO30	Q8TB52	745 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	RNF31	Q96EP0	1072 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	COL21A1	Q96P44	957 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958		A0A1W2PQ09	198 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	GJB1	P08034	283 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	TPH1	P17752	444 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	PRKACG	P22612	351 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	GRK5	P34947	590 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	SOX9	P48436	509 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	PER3	P56645	1201 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	S100A12	P80511	92 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	RHAG	Q02094	409 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	LCP2	Q13094	533 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	MAB21L1	Q13394	359 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	IRF3	Q14653	427 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	ZNF79	Q15937	498 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	C17orf99	Q6UX52	265 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	BNIPL	Q7Z465	357 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	SNX20	Q7Z614	316 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	CYP4Z2P	Q8N1L4	340 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	OR8K5	Q8NH50	307 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	ZNF675	Q8TD23	568 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958		Q96MT0	163 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	PCYT2	Q99447	389 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958		I3L521	148 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	ATG13	O75143	517 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CPEB1-215	ENST00000617958	SLC25A27	O95847	323 aa		10.47	□□□□□ -0.73

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