RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KCTD21Q4G0X4 260 aa11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LILRA6Q6PI73 481 aa11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR2A12Q8NGT7 310 aa11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NETO1Q8TDF5 533 aa11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SGCDQ92629 289 aa11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM162AQ96A26 154 aa11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TOX2Q96NM4 488 aa11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HIST1H2AJQ99878 128 aa11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 H2AFJQ9BTM1 129 aa11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC12A9Q9BXP2 914 aa11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZBP1Q9H171 429 aa11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SERHLQ9NQF3 203 aa11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ASAH2Q9NR71 780 aa11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GPRC5BQ9NZH0 403 aa11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PPT2Q9UMR5 302 aa11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF510Q9Y2H8 683 aa11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CXCR6O00574 342 aa11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BMP10O95393 424 aa11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CST1P01037 141 aa11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ALBP02768 609 aa11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ALPLP05186 524 aa11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HALP42357 657 aa11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC14A1Q13336 389 aa11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARHGEF6Q15052 776 aa11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TEAD2Q15562 447 aa11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RUNDC3AQ59EK9 446 aa11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KLHL23Q8NBE8 558 aa11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TTC34A8MYJ7 566 aa11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CTSAP10619 480 aa11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TYRP14679 529 aa11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SDC1P18827 310 aa11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SHMT2P34897 504 aa11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CDK9P50750 372 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MAPK10P53779 464 aa11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ABRQ12979 859 aa11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NEDD8Q15843 81 aa11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GPR141Q7Z602 305 aa11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GALNT10Q86SR1 603 aa11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ELMO1Q92556 727 aa11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CD320Q9NPF0 282 aa11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC25A13Q9UJS0 675 aa11.49□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GRM6O15303 877 aa11.48□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TULP3O75386 442 aa11.48□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LEFTY1O75610 366 aa11.48□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CBSLP0DN79 551 aa11.48□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CDK4P11802 303 aa11.48□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 S100A3P33764 101 aa11.48□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CBSP35520 551 aa11.48□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ERVFC1P60507 584 aa11.48□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CHIT1Q13231 466 aa11.48□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C11orf91Q3C1V1 193 aa11.48□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CCSMST1Q4G0I0 132 aa11.48□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARSIQ5FYB1 569 aa11.48□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LY6G5CQ5SRR4 150 aa11.48□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR4F3Q6IEY1 312 aa11.48□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ADNP2Q6IQ32 1131 aa11.48□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GDPD4Q6W3E5 623 aa11.48□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRR23BQ6ZRT6 265 aa11.48□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 USP51Q70EK9 711 aa11.48□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa11.48□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ADIPOR2Q86V24 386 aa11.48□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa11.48□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TNIP2Q8NFZ5 429 aa11.48□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CDC26Q8NHZ8 85 aa11.48□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC47A1Q96FL8 570 aa11.48□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GORASP2Q9H8Y8 452 aa11.48□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa11.48□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PPIL1Q9Y3C6 166 aa11.48□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NOTCH4Q99466 2003 aa11.48□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa11.48□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 G3V2T6 193 aa11.48□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GNGT2O14610 69 aa11.48□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SGTAO43765 313 aa11.48□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ALDH3A2P51648 485 aa11.48□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NTHL1P78549 312 aa11.48□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DAG1Q14118 895 aa11.48□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LAPTM4AQ15012 233 aa11.48□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PON2Q15165 354 aa11.48□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPESP1Q6UW49 350 aa11.48□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NECAB2Q7Z6G3 386 aa11.48□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ELMOD1Q8N336 334 aa11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 112.6 ms