RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592578.5

PSME3-215, Transcript of proteasome activator subunit 3, human

TSL 4

Gene PSME3, Length 549 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME3-215	ENST00000592578	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PSME3-215	ENST00000592578	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PSME3-215	ENST00000592578	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PSME3-215	ENST00000592578	IP6K3	Q96PC2	410 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PSME3-215	ENST00000592578	IL22	Q9GZX6	179 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PSME3-215	ENST00000592578	XKR8	Q9H6D3	395 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PSME3-215	ENST00000592578	BFAR	Q9NZS9	450 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PSME3-215	ENST00000592578	TMEM150C	B9EJG8	249 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	BHMG1	C9JSJ3	638 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	ST6GAL1	P15907	406 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	NPY2R	P49146	381 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	TTPA	P49638	278 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	OR5K2	Q8NHB8	316 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	CPT1B	Q92523	772 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	LRFN5	Q96NI6	719 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	RUFY1	Q96T51	708 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	CARD6	Q9BX69	1037 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	NLN	Q9BYT8	704 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	COPG2	Q9UBF2	871 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	ICK	Q9UPZ9	632 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	MEN1	O00255	615 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	CYP2A7	P20853	494 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	KCNJ1	P48048	391 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	CCZ1B	P86790	482 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	CDK16	Q00536	496 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	GPS2	Q13227	327 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	SEMA3A	Q14563	771 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	SPESP1	Q6UW49	350 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	NRTN	Q99748	197 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	TCFL5	Q9UL49	500 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	PADI2	Q9Y2J8	665 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578		E7EQ34	232 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	RPN2	P04844	631 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	APOA4	P06727	396 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	HBQ1	P09105	142 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	PVR	P15151	417 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	UGT2B7	P16662	529 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	CCR7	P32248	378 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	CXCR5	P32302	372 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	CRADD	P78560	199 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	ABR	Q12979	859 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	GPR135	Q8IZ08	494 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	MPP5	Q8N3R9	675 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	OR1L3	Q8NH93	324 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	COG1	Q8WTW3	980 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	PANX3	Q96QZ0	392 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	OR2A14	Q96R47	310 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	CHST8	Q9H2A9	424 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	CHST11	Q9NPF2	352 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	TREX1	Q9NSU2	369 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	IQCF5	A8MTL0	148 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578		C9J4A7	227 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	PEX12	O00623	359 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	GPC4	O75487	556 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	NDUFS3	O75489	264 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	TPSB2	P20231	275 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	NMBR	P28336	390 aa		13.74	□□□□□ -0.21

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