RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589528.1

ACTN4-211, Transcript of actinin alpha 4, humanhuman

TSL 2

Gene ACTN4, Length 441 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4-211ENST00000589528 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 FBN2P35556 2912 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 DSCR3O14972 297 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 MAGP20916 626 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 KCNK10P57789 538 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 ART3Q13508 389 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 TRIM14Q14142 442 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 NKG7Q16617 165 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 KIRREL2Q6UWL6 708 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 RCOR2Q8IZ40 523 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 CCDC110Q8TBZ0 833 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 GORASP1Q9BQQ3 440 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 HEMGNQ9BXL5 484 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 SLC22A11Q9NSA0 550 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 CUTCQ9NTM9 273 aa14.62□□□□□ -0.07
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ACTN4-211ENST00000589528 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 KLHL20Q9Y2M5 609 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 PCNX1Q96RV3 2341 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 CSMD2Q7Z408 3487 aa14.61□□□□□ -0.07
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ACTN4-211ENST00000589528 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 AP2A1O95782 977 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 APOC2P02655 101 aa14.61□□□□□ -0.07
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ACTN4-211ENST00000589528 PRSS56P0CW18 603 aa14.61□□□□□ -0.07
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ACTN4-211ENST00000589528 NSG1P42857 185 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 CACNG1Q06432 222 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 MFAP5Q13361 173 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 SPARCL1Q14515 664 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 GRM7Q14831 915 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 GFRALQ6UXV0 394 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 FAM20CQ8IXL6 584 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 KATNAL2Q8IYT4 538 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 CATSPER1Q8NEC5 780 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 OR11G2Q8NGC1 345 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 RELTQ969Z4 430 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 SLC22A18Q96BI1 424 aa14.61□□□□□ -0.07
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ACTN4-211ENST00000589528 SLC26A1Q9H2B4 701 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 CHST11Q9NPF2 352 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 CTSFQ9UBX1 484 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 F8W8V4 182 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 MAP2K7O14733 419 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 KCNN4O15554 427 aa14.6□□□□□ -0.07
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ACTN4-211ENST00000589528 CARSP49589 748 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
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ACTN4-211ENST00000589528 VWA2Q5GFL6 755 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 TCTE1Q5JU00 501 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 MTFR2Q6P444 385 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 NAPRTQ6XQN6 538 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 BBS12Q6ZW61 710 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 SELENOSQ9BQE4 189 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 ZNF160Q9HCG1 818 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 ALG6Q9Y672 507 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 MAU2Q9Y6X3 613 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 MED13LQ71F56 2210 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 TRAV17A0A0B4J275 112 aa14.59□□□□□ -0.07
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ACTN4-211ENST00000589528 CCL21O00585 134 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 USP1O94782 785 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 HPP00738 406 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 RPN2P04844 631 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 OR56A5P0C7T3 313 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 MCM3P25205 808 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 HTR1EP28566 365 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ACTN4-211ENST00000589528 PKLRP30613 574 aa14.59□□□□□ -0.07
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