RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 GFYI3L273 518 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 MATN2O00339 956 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 SPAG6O75602 509 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 CATP04040 527 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 FDXRP22570 491 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 OAS2P29728 719 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 ATP5DP30049 168 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 PKLRP30613 574 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 GRIA3P42263 894 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 RAB28P51157 221 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC12A2P55011 1212 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 TAS2R39P59534 338 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 IL2P60568 153 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 IL11RAQ14626 422 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 KIR2DS3Q14952 304 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 SUSD1Q6UWL2 747 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM207Q6UWW9 146 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 CYS1Q717R9 158 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 GALNT7Q86SF2 657 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 KMT5CQ86Y97 462 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 CEP97Q8IW35 865 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 IFT20Q8IY31 132 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 MYO1HQ8N1T3 1032 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 D2HGDHQ8N465 521 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 RAB42Q8N4Z0 105 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 PPM1NQ8N819 430 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 PPFIBP2Q8ND30 876 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 OR2L8Q8NGY9 312 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 MCOLN3Q8TDD5 553 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 DENND1AQ8TEH3 1009 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 ASB11Q8WXH4 323 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 DLG3Q92796 817 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC22A18Q96BI1 424 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 LINGO1Q96FE5 620 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC41A2Q96JW4 573 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 MENTQ9BUN1 341 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 DDA1Q9BW61 102 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 DPH1Q9BZG8 443 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM60AQ9NP50 221 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 PDE7BQ9NP56 450 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 FGF21Q9NSA1 209 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 NINJ2Q9NZG7 142 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 SEMA5BQ9P283 1151 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 RARRES3Q9UL19 164 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 NFU1Q9UMS0 254 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A087WV48 116 aa6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A0J9YY10 115 aa6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM150CB9EJG8 249 aa6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 HCRTR1O43613 425 aa6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 KRT37O76014 449 aa6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 STK17BO94768 372 aa6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 KIAA0754O94854 1291 aa6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 NTRK1P04629 796 aa6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 LIPCP11150 499 aa6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 FGF5P12034 268 aa6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF28P17035 718 aa6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 CYP2A7P20853 494 aa6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 PSMB5P28074 263 aa6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 SPRP35270 261 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 PNLIPRP1P54315 467 aa6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 RAB15P59190 212 aa6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 YBX1P67809 324 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 ACY1Q03154 408 aa6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 CLN3Q13286 438 aa6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 TUBB3Q13509 450 aa6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF460Q14592 562 aa6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 USP10Q14694 798 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP6.56□□□□□ -1.365e-6■■■■■ 32.5
EFTUD2-211ENST00000588374 ZIC1Q15915 447 aa6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC5A12Q1EHB4 618 aa6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 COL28A1Q2UY09 1125 aa6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 TEX35Q5T0J7 233 aa6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 GRTP1Q5TC63 336 aa6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 BROXQ5VW32 411 aa6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60 ms