RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585907.1

PRKAR1A-209, Transcript of protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit alpha, human

TSL 2

Gene PRKAR1A, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKAR1A-209	ENST00000585907	SEMG2	Q02383	582 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	KRT72	Q14CN4	511 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	TOMM20	Q15388	145 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	PYCR3	Q53H96	274 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	HES3	Q5TGS1	186 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	KCTD16	Q68DU8	428 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	NRROS	Q86YC3	692 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	ZNF567	Q8N184	647 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	PELI3	Q8N2H9	469 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	HIPK4	Q8NE63	616 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	IFI44	Q8TCB0	444 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	ASB15	Q8WXK1	588 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	AP2M1	Q96CW1	435 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	EID2B	Q96D98	161 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	NXPE2	Q96DL1	559 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	PDXP	Q96GD0	296 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	HIC2	Q96JB3	615 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	AGAP3	Q96P47	875 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	VPS35	Q96QK1	796 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	AMFR	Q9UKV5	643 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	PADI4	Q9UM07	663 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	TFR2	Q9UP52	801 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907		A0A087WV48	116 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	C5orf60	A6NFR6	353 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	AGAP14	A8MT82	685 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907		A8MX80	341 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	TAF4	O00268	1085 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	CHUK	O15111	745 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	KRT86	O43790	486 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	VEGFD	O43915	354 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	KCNJ13	O60928	360 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	FGF1	P05230	155 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	RBP3	P10745	1247 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	PSMA3	P25788	255 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	RBL1	P28749	1068 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	CCKBR	P32239	447 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	ADRA1A	P35348	466 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	GPR3	P46089	330 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	FASLG	P48023	281 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	LSS	P48449	732 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	GEM	P55040	296 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	WNT3A	P56704	352 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	DYNLT1	P63172	113 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	4.74	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	4.74	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	C1orf61	Q13536	156 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	PTPRR	Q15256	657 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	SLC1A5	Q15758	541 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	ISX	Q2M1V0	245 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	GUSBP11	Q6P575	273 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	RANBP10	Q6VN20	620 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907		Q6ZRM9	215 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	PID1	Q7Z2X4	250 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	PEX26	Q7Z412	305 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	KRT77	Q7Z794	578 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	KIAA1328	Q86T90	577 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRKAR1A-209	ENST00000585907	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		4.74	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms