RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582232.1

GGA3-211, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 2

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-211	ENST00000582232	PKLR	P30613	574 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	PNLIPRP1	P54315	467 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	PPP2R2A	P63151	447 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	STPG1	Q5TH74	334 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	AGTRAP	Q6RW13	159 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	NAXD	Q8IW45	347 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	OR56A3	Q8NH54	315 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	ZNF480	Q8WV37	535 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	LCN9	Q8WX39	176 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	NAT6	Q93015	286 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	CD274	Q9NZQ7	290 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232		A8MT66	165 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232		E7ENX8	843 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	BIRC5	O15392	142 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	TAPBP	O15533	448 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	ZW10	O43264	779 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	GDF9	O60383	454 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	DLX3	O60479	287 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	SUPT3H	O75486	399 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	MYL2	P10916	166 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	CKMT2	P17540	419 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	NR1D1	P20393	614 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	CCND1	P24385	295 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	ACP1	P24666	158 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	SLC6A12	P48065	614 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	PRKAA2	P54646	552 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	DNAJB13	P59910	316 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	TAP2	Q03519	686 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	BIRC2	Q13490	618 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	SQSTM1	Q13501	440 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	PCLAF	Q15004	111 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	SETDB1	Q15047	1291 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	PFKFB4	Q16877	469 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	PIP4P1	Q86T03	277 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	SLC38A3	Q99624	504 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	CDC6	Q99741	560 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	EGFL8	Q99944	293 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	RAB33B	Q9H082	229 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	SRMS	Q9H3Y6	488 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	OXSM	Q9NWU1	459 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	PLAGL1	Q9UM63	463 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-211	ENST00000582232	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		11.15	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232		A0A1W2PPV9	198 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	KRT87P	A6NCN2	255 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	MATN2	O00339	956 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	SH3BP5	O60239	455 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	UBXN7	O94888	489 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	GP1BA	P07359	652 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	BPGM	P07738	259 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	GFAP	P14136	432 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	IMPDH1	P20839	514 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	SERPINB4	P48594	390 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	NAA20	P61599	178 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	HERVK_113	P63132	956 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	GPLD1	P80108	840 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	PLCL1	Q15111	1095 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	GUSBP11	Q6P575	273 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	KLHL35	Q6PF15	583 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	CCDC63	Q8NA47	563 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	OR4E2	Q8NGC2	313 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	SMPDL3A	Q92484	453 aa		11.14	□□□□□ -0.63

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