RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579815.1

CLTC-211, Transcript of clathrin heavy chain, humanhuman

TSL 5

Gene CLTC, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTC-211ENST00000579815 GBP5Q96PP8 586 aa6.2□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 ZNF382Q96SR6 550 aa6.2□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 NPAS2Q99743 824 aa6.2□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 TRIM54Q9BYV2 358 aa6.2□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 MAGEE1Q9HCI5 957 aa6.2□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 MID1IP1Q9NPA3 183 aa6.2□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP6.2□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 RIC8BQ9NVN3 520 aa6.2□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 ADA2Q9NZK5 511 aa6.2□□□□□ -1.42
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CLTC-211ENST00000579815 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
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CLTC-211ENST00000579815 SUFUQ9UMX1 484 aa6.2□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 PKP3Q9Y446 797 aa6.2□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 RAI2Q9Y5P3 530 aa6.2□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa6.2□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 SCN8AQ9UQD0 1980 aa6.2□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 A0A0J9YYE9 177 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 KANSL1LA0AUZ9 987 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 E5RI56 91 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 H0Y626 953 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 ACOT7O00154 380 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 CBX4O00257 560 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 FBP2O00757 339 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 PIP5K1BO14986 540 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 ANGPT2O15123 496 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 CFLARO15519 480 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 PDPK1O15530 556 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 AHCYL1O43865 530 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 SNX2O60749 519 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 EFCAB14O75071 495 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 ECI2O75521 394 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 GJB5O95377 273 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 OLFM2O95897 454 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 PLATP00750 562 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 S100BP04271 92 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 URODP06132 367 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 CKMP06732 381 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 FESP07332 822 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 FCGR1AP12314 374 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 VCLP18206 1134 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 LAG3P18627 525 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 MSH3P20585 1137 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 SLC7A1P30825 629 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 FMO4P31512 558 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 MC4RP32245 332 aa6.19□□□□□ -1.42
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CLTC-211ENST00000579815 CHN2P52757 468 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 PGGT1BP53609 377 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 IL2P60568 153 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 RHOAP61586 193 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 RPS24P62847 133 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 ARF5P84085 180 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 TRAF2Q12933 501 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 PDK3Q15120 406 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 ADRM1Q16186 407 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 PFKFB4Q16877 469 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 DEFB115Q30KQ5 88 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 XKR7Q5GH72 579 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 ARMC12Q5T9G4 340 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 LPCAT4Q643R3 524 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 CLEC6AQ6EIG7 209 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 RETSATQ6NUM9 610 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 TTC23LQ6PF05 361 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 CYHR1Q6ZMK1 362 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa6.19□□□□□ -1.42
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CLTC-211ENST00000579815 SPATA24Q86W54 205 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 TCEAL8Q8IYN2 117 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 AHI1Q8N157 1196 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 CFAP52Q8N1V2 620 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 CPXM2Q8N436 756 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 PACRGLQ8N7B6 248 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP6.19□□□□□ -1.421e-7■■□□□ 12.3
CLTC-211ENST00000579815 CD200R1Q8TD46 325 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 EXT2Q93063 718 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 MOCOSQ96EN8 888 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 MARK4Q96L34 752 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 B3GALT6Q96L58 329 aa6.19□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 ZNF558Q96NG5 402 aa6.19□□□□□ -1.42
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