RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568870.1

TCF25-223, Transcript of transcription factor 25, human

TSL 2

Gene TCF25, Length 263 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF25-223	ENST00000568870	KCNK5	O95279	499 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	SLC16A8	O95907	504 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	GSTA1	P08263	222 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	ANXA5	P08758	320 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	RBP1	P09455	135 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	CD1C	P29017	333 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	CAPZB	P47756	277 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	CCT5	P48643	541 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	PNLIPRP1	P54315	467 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	AP1S2	P56377	157 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	ILK	Q13418	452 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	SPIDR	Q14159	915 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	TGFBI	Q15582	683 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	ANKS6	Q68DC2	871 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	IRGC	Q6NXR0	463 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	C16orf46	Q6P387	395 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	LCA5	Q86VQ0	697 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	MED8	Q96G25	268 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	RDH14	Q9HBH5	336 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	OGFR	Q9NZT2	677 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	TMEM216	Q9P0N5	145 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	SENP1	Q9P0U3	644 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	STOX2	Q9P2F5	926 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	XPR1	Q9UBH6	696 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	KLHL3	Q9UH77	587 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	OR5K3	A6NET4	321 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	SYCE1L	A8MT33	242 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	ISM1	B1AKI9	464 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	AGPS	O00116	658 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	UBXN8	O00124	270 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	OPA1	O60313	960 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	SASH3	O75995	380 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	GFAP	P14136	432 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	IMPA1	P29218	277 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	CSF2RB	P32927	897 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	HSD17B2	P37059	387 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	KCNC1	P48547	511 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	CDKL1	Q00532	357 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	E2F1	Q01094	437 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	SLC18A2	Q05940	514 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	AGTRAP	Q6RW13	159 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	DHRS13	Q6UX07	377 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	CCDC63	Q8NA47	563 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	ZNF480	Q8WV37	535 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	ATL1	Q8WXF7	558 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	APOPT1	Q96IL0	206 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	TGM7	Q96PF1	710 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	MRPL57	Q9BQC6	102 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	MENT	Q9BUN1	341 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	WWOX	Q9NZC7	414 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	CEP250	Q9BV73	2442 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF25-223	ENST00000568870	PCM1	Q15154	2024 aa		13.46	□□□□□ -0.26
TCF25-223	ENST00000568870	CCDC189	A1A4V9	331 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF25-223	ENST00000568870	C2orf74	A8MZ97	194 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF25-223	ENST00000568870	TK2	O00142	265 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF25-223	ENST00000568870	MAP2K7	O14733	419 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF25-223	ENST00000568870	CPNE6	O95741	557 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF25-223	ENST00000568870	CREB1	P16220	341 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF25-223	ENST00000568870	MPST	P25325	297 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF25-223	ENST00000568870	CRHR1	P34998	444 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF25-223	ENST00000568870	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TCF25-223	ENST00000568870	GFER	P55789	205 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF25-223	ENST00000568870	PPP1CA	P62136	330 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF25-223	ENST00000568870	CYP2A13	Q16696	494 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF25-223	ENST00000568870	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF25-223	ENST00000568870	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		13.45	□□□□□ -0.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms