RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 FOLR3P41439 243 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 GRIA3P42263 894 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 GABRA4P48169 554 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 VPS41P49754 854 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 GSTM4Q03013 218 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 RPS6KA1Q15418 735 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 CNSTQ6PJW8 725 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 GSTA5Q7RTV2 222 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPNS2Q8IVW8 549 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC22A15Q8IZD6 547 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 DTWD1Q8N5C7 304 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 LINC01555Q8NAE3 123 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 LRRN4CLQ8ND94 238 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 FDCSPQ8NFU4 85 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 TCTN2Q96GX1 697 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 SGSM3Q96HU1 749 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 RANBP9Q96S59 729 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 TTC1Q99614 292 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 TSSK1BQ9BXA7 367 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 AP1M1Q9BXS5 423 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 TSGA10Q9BZW7 698 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 SYTL2Q9HCH5 934 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 CASS4Q9NQ75 786 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 GPR83Q9NYM4 423 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR6C2Q9NZP2 312 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 PAK5Q9P286 719 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 POLG2Q9UHN1 485 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 ANAPC5Q9UJX4 755 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 PADI2Q9Y2J8 665 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 MRFAP1Q9Y605 127 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 NFS1Q9Y697 457 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 NAV2Q8IVL1 2488 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 H3BMH7 237 aa6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 KIF5CO60282 957 aa6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 KDM1AO60341 852 aa6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 NRP2O60462 931 aa6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 VPS4BO75351 444 aa6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 NDUFS3O75489 264 aa6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 AGFG2O95081 481 aa6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 RECKO95980 971 aa6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 FGGP02679 453 aa6.9□□□□□ -1.3
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CCNDBP1-212ENST00000567690 MSL3P1P0C860 447 aa6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 ALAS2P22557 587 aa6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 PSMA3P25788 255 aa6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 MGAT1P26572 445 aa6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 CXCR5P32302 372 aa6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 KCNJ1P48048 391 aa6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 CD97P48960 835 aa6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 RAB28P51157 221 aa6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 RRADP55042 308 aa6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 DCDP81605 110 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 ACVR1Q04771 509 aa6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 KIR2DS3Q14952 304 aa6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC5A12Q1EHB4 618 aa6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCSMST1Q4G0I0 132 aa6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 PCID2Q5JVF3 399 aa6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 MEI1Q5TIA1 1274 aa6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC6A19Q695T7 634 aa6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 RHBDD2Q6NTF9 364 aa6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 TTLL10Q6ZVT0 673 aa6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRSS58Q8IYP2 241 aa6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 DNAJC22Q8N4W6 341 aa6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM26EQ8N5C1 309 aa6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 GSDMBQ8TAX9 411 aa6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 ASZ1Q8WWH4 475 aa6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 GBP5Q96PP8 586 aa6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 MIPEPQ99797 713 aa6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 NDC1Q9BTX1 674 aa6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLAMF7Q9NQ25 335 aa6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF446Q9NWS9 450 aa6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 SYBUQ9NX95 663 aa6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 EURLQ9NYK6 297 aa6.9□□□□□ -1.3
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