RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558966.5

CTDSPL2-204, Transcript of CTD small phosphatase like 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSPL2, Length 1,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2-204ENST00000558966 BFARQ9NZS9 450 aa5.86□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 EPHA6Q9UF33 1036 aa5.86□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa5.86□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 FASNP49327 2511 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa5.86□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 SPTBP11277 2137 aa5.86□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 RGS13O14921 159 aa5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 AVILO75366 819 aa5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 GSTM1P09488 218 aa5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 LIPCP11150 499 aa5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 NPY2RP49146 381 aa5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 SEPHS1P49903 392 aa5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 MC2RQ01718 297 aa5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 ANKS6Q68DC2 871 aa5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 ANKRD34AQ69YU3 496 aa5.85□□□□□ -1.47
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CTDSPL2-204ENST00000558966 NAPRTQ6XQN6 538 aa5.85□□□□□ -1.47
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CTDSPL2-204ENST00000558966 FAM92BQ6ZTR7 304 aa5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 PRSS42Q7Z5A4 293 aa5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 MPP5Q8N3R9 675 aa5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa5.85□□□□□ -1.47
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CTDSPL2-204ENST00000558966 KIFC1Q9BW19 673 aa5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 DDA1Q9BW61 102 aa5.85□□□□□ -1.47
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CTDSPL2-204ENST00000558966 AKTIPQ9H8T0 292 aa5.85□□□□□ -1.47
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CTDSPL2-204ENST00000558966 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
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CTDSPL2-204ENST00000558966 SLC39A1Q9NY26 324 aa5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 SEMA5BQ9P283 1151 aa5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 SLC24A2Q9UI40 661 aa5.85□□□□□ -1.47
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CTDSPL2-204ENST00000558966 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 ESYT3A0FGR9 886 aa5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 SLC5A10A0PJK1 596 aa5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 OR5K3A6NET4 321 aa5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 AP3B1O00203 1094 aa5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 QSOX1O00391 747 aa5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 RASSF9O75901 435 aa5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 FTH1P02794 183 aa5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 TP53P04637 393 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 OR56A5P0C7T3 313 aa5.85□□□□□ -1.47
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CTDSPL2-204ENST00000558966 ACADLP28330 430 aa5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 MAGEA3P43357 314 aa5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 CD151P48509 253 aa5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 UCNP55089 124 aa5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 TMPRSS3P57727 454 aa5.85□□□□□ -1.47
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CTDSPL2-204ENST00000558966 SLC7A5Q01650 507 aa5.85□□□□□ -1.47
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CTDSPL2-204ENST00000558966 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 BRD3Q15059 726 aa5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 PLCL1Q15111 1095 aa5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 BROXQ5VW32 411 aa5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 VASH2Q86V25 355 aa5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 CREG2Q8IUH2 290 aa5.85□□□□□ -1.47
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CTDSPL2-204ENST00000558966 MCUQ8NE86 351 aa5.85□□□□□ -1.47
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CTDSPL2-204ENST00000558966 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 MAP3K3Q99759 626 aa5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 SPRY4Q9C004 299 aa5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 P2RY12Q9H244 342 aa5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 FBXO8Q9NRD0 319 aa5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa5.85□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 SEC16AO15027 2179 aa5.84□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 OR6C74A6NCV1 312 aa5.84□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 TLCD2A6NGC4 264 aa5.84□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 IQCF5A8MTL0 148 aa5.84□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 GOLGA8KD6RF30 607 aa5.84□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 STMND1H3BQB6 276 aa5.84□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 GOLGA8TH3BQL2 631 aa5.84□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 GOLGA8MH3BSY2 632 aa5.84□□□□□ -1.47
CTDSPL2-204ENST00000558966 K7ENP7 123 aa5.84□□□□□ -1.47
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