RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557076.5

SCFD1-223, Transcript of sec1 family domain containing 1, human

TSL 3

Gene SCFD1, Length 743 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCFD1-223	ENST00000557076	CAPN1	P07384	714 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	F3	P13726	295 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	TYRP1	P17643	537 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	SYT1	P21579	422 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	SDHA	P31040	664 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	PBX1	P40424	430 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	MAPK9	P45984	424 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	FMO5	P49326	533 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	CLCNKA	P51800	687 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	TUBB4B	P68371	445 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	LTB	Q06643	244 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	GPS2	Q13227	327 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	TUBB3	Q13509	450 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	TUBB2A	Q13885	445 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	RABEP1	Q15276	862 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	FAM209A	Q5JX71	171 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	RESP18	Q5W5W9	173 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	ARC	Q7LC44	396 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	SRL	Q86TD4	932 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	KMT5C	Q86Y97	462 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	RAB43	Q86YS6	212 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	CEP97	Q8IW35	865 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	BCORP1	Q8N888	145 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	SHC3	Q92529	594 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	MR1	Q95460	341 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	NUS1	Q96E22	293 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	DTD2	Q96FN9	168 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	TBCB	Q99426	244 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	FGF21	Q9NSA1	209 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	LHX3	Q9UBR4	397 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	SPTB	P11277	2137 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076		A8MX80	341 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	FAM72C	H0Y354	149 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	C19orf84	I3L1E1	186 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	MASP2	O00187	686 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	PEX12	O00623	359 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	DNAJC6	O75061	913 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	SOD1	P00441	154 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	ERBB2	P04626	1255 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	PYGL	P06737	847 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	CD63	P08962	238 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	SERPINA4	P29622	427 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	PTGS2	P35354	604 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	RORA	P35398	523 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	CA7	P43166	264 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	GPR1	P46091	355 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	GABRB2	P47870	512 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	MAN2A2	P49641	1150 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	SULT1E1	P49888	294 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	SMS	P52788	366 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	IST1	P53990	364 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	KCNK10	P57789	538 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	CSNK1G2	P78368	415 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	HSD11B2	P80365	405 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	BCL2L1	Q07817	233 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	CDC16	Q13042	620 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	ATP1A4	Q13733	1029 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	KYNU	Q16719	465 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	PARP15	Q460N3	678 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	FAM72A	Q5TYM5	149 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	LCN10	Q6JVE6	187 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	FAM72D	Q6L9T8	149 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076		Q6ZVL8	140 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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