RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551253.5

CS-225, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 676 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-225ENST00000551253 CLDN7O95471 211 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 PYGLP06737 847 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 GOLGA6DP0CG33 693 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 OTX2P32243 289 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 CXCR5P32302 372 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 ADRA1AP35348 466 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 ETV3P41162 512 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 ACTR1BP42025 376 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 SPINT3P49223 89 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 EPHA4P54764 986 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 ACTR1AP61163 376 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 GPS2Q13227 327 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 PTPRRQ15256 657 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 SLC1A5Q15758 541 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 LONRF2Q1L5Z9 754 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 PARP6Q2NL67 630 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 DENND2CQ68D51 928 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 RAET1GQ6H3X3 334 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 Q6ZVL8 140 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 TMC3Q7Z5M5 1100 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 VWA5B2Q8N398 1253 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 FAM71DQ8N9W8 422 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 IPMKQ8NFU5 416 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 CCHCR1Q8TD31 782 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 AGAP11Q8TF27 550 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 C1orf54Q8WWF1 131 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 LRRC45Q96CN5 670 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 OR2M4Q96R27 311 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 OSBPL9Q96SU4 736 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 FSD1LQ9BXM9 530 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 ABCG8Q9H221 673 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 EPB41L1Q9H4G0 881 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 HOMER3Q9NSC5 361 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 SNX12Q9UMY4 172 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 ZNF711Q9Y462 761 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.311e-7■□□□□ 8.6
CS-225ENST00000551253 ARID1AO14497 2285 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 USF3Q68DE3 2245 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 SEC16AO15027 2179 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 PSMD3O43242 534 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 WISP2O76076 250 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 METTL18O95568 372 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 SOD1P00441 154 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 TCP1P17987 556 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 CHRNB4P30926 498 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 HMGCLP35914 325 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 FDFT1P37268 417 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 HADHAP40939 763 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 GPR1P46091 355 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 POLD2P49005 469 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 DCDC1P59894 354 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 SNX1Q13596 522 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 LRP8Q14114 963 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 SSPNQ14714 243 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 CYP1B1Q16678 543 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 PYCR3Q53H96 274 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 SIRPB2Q5JXA9 342 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 PRR31Q5SQ13 230 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 KCTD11Q693B1 232 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 LCN10Q6JVE6 187 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 ARSKQ6UWY0 536 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 RANBP10Q6VN20 620 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 RFLNAQ6ZTI6 216 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 DOLPP1Q86YN1 238 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 SFRP1Q8N474 314 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 SLC25A41Q8N5S1 370 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 ACTRT1Q8TDG2 376 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 AP2M1Q96CW1 435 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 EID2BQ96D98 161 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 LRFN5Q96NI6 719 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 LMF1Q96S06 567 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 WDR24Q96S15 920 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 FICDQ9BVA6 458 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 ARNT2Q9HBZ2 717 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 DMRT3Q9NQL9 472 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 RAD18Q9NS91 495 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 P4HTMQ9NXG6 502 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 HACD3Q9P035 362 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 PAK5Q9P286 719 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 CD84Q9UIB8 345 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 SHOC2Q9UQ13 582 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-225ENST00000551253 ZNF148Q9UQR1 794 aa6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.8 ms