RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 CCL4P13236 92 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 ETV5P41161 510 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 MAPK10P53779 464 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 EPHA4P54764 986 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 GFERP55789 205 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 HSPA14Q0VDF9 509 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 MORF4L2Q15014 288 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 PLCL1Q15111 1095 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
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CS-217ENST00000550044 DENND6AQ8IWF6 608 aa9.36□□□□□ -0.91
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CS-217ENST00000550044 RSC1A1Q92681 617 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
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CS-217ENST00000550044 TGM7Q96PF1 710 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 CMKLR1Q99788 373 aa9.36□□□□□ -0.91
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CS-217ENST00000550044 SAP130Q9H0E3 1048 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 P2RY12Q9H244 342 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 FOXJ2Q9P0K8 574 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 CDC23Q9UJX2 597 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 FAM169AQ9Y6X4 670 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 CELSR2Q9HCU4 2923 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 CSMD1Q96PZ7 3565 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 OR6C74A6NCV1 312 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 F8W8V4 182 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 TP73O15350 636 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 NVLO15381 856 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 AGFG2O95081 481 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 GSTM1P09488 218 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 ERVK-10P10266 1014 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 THRAP10827 490 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 PGAM1P18669 254 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP9.35□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 ELK3P41970 407 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 CD151P48509 253 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 SEPHS1P49903 392 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 RIPPLY3P57055 190 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 PPP1CAP62136 330 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 GSTM4Q03013 218 aa9.35□□□□□ -0.91
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CS-217ENST00000550044 ARMC3Q5W041 872 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 ZNF470Q6ECI4 717 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 IRGCQ6NXR0 463 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 FAM92BQ6ZTR7 304 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 ATCAYQ86WG3 371 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 PLXDC1Q8IUK5 500 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 CILP2Q8IUL8 1156 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 PDIK1LQ8N165 341 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 CFAP61Q8NHU2 1237 aa9.35□□□□□ -0.91
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CS-217ENST00000550044 USP7Q93009 1102 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 TMEM159Q96B96 161 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 CFAP36Q96G28 342 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 BIRC8Q96P09 236 aa9.35□□□□□ -0.91
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CS-217ENST00000550044 DPYSL5Q9BPU6 564 aa9.35□□□□□ -0.91
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CS-217ENST00000550044 TSSK1BQ9BXA7 367 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 EPB41L1Q9H4G0 881 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 PIF1Q9H611 641 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 XKR8Q9H6D3 395 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
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CS-217ENST00000550044 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 PDP2Q9P2J9 529 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 GALPQ9UBC7 116 aa9.35□□□□□ -0.91
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CS-217ENST00000550044 GNPTGQ9UJJ9 305 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 CHMP2BQ9UQN3 213 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 ASF1AQ9Y294 204 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 A1L4Q6 167 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 EFCAB7A8K855 629 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 PFDN6O15212 129 aa9.34□□□□□ -0.91
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