RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548132.1

GCN1-204, Transcript of GCN1, eIF2 alpha kinase activator homolog, human

TSL 3

Gene GCN1, Length 498 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCN1-204	ENST00000548132	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	NIPSNAP2	O75323	286 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	UQCRFS1	P47985	274 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	SLC9A5	Q14940	896 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	KIR2DS3	Q14952	304 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	C1orf189	Q5VU69	101 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	COX15	Q7KZN9	410 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132		Q8NA96	180 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	THAP4	Q8WY91	577 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	SEC14L1	Q92503	715 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	TCTN2	Q96GX1	697 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	ZNF285	Q96NJ3	590 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	IL22	Q9GZX6	179 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	ING2	Q9H160	280 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	GALP	Q9UBC7	116 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	POLG2	Q9UHN1	485 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	SOX13	Q9UN79	622 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	MASP2	O00187	686 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	RASGRF2	O14827	1237 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	AVIL	O75366	819 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	OR2B3	O76000	313 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	UMOD	P07911	640 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	ERG	P11308	486 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	MAGEA3	P43357	314 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	MLLT10	P55197	1068 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	NADK2	Q4G0N4	442 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	CENPU	Q71F23	418 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	TRIM58	Q8NG06	486 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	SLC30A3	Q99726	388 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	CTSV	O60911	334 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	C1orf105	O95561	183 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	CD9	P21926	228 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	MCM3	P25205	808 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	TTPA	P49638	278 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	VPS41	P49754	854 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	SPSB2	Q99619	263 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	EURL	Q9NYK6	297 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	KLK4	Q9Y5K2	254 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	CENPE	Q02224	2701 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GCN1-204	ENST00000548132	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GCN1-204	ENST00000548132	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GCN1-204	ENST00000548132	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GCN1-204	ENST00000548132	ISM1	B1AKI9	464 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GCN1-204	ENST00000548132	CEP104	O60308	925 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GCN1-204	ENST00000548132	VAPB	O95292	243 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GCN1-204	ENST00000548132	GAS8	O95995	478 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GCN1-204	ENST00000548132	APOA4	P06727	396 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GCN1-204	ENST00000548132	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
GCN1-204	ENST00000548132	PGD	P52209	483 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GCN1-204	ENST00000548132	TERF1	P54274	439 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GCN1-204	ENST00000548132	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
GCN1-204	ENST00000548132	TMED2	Q15363	201 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GCN1-204	ENST00000548132	CYP1B1	Q16678	543 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GCN1-204	ENST00000548132	CNST	Q6PJW8	725 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GCN1-204	ENST00000548132	RNF44	Q7L0R7	432 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GCN1-204	ENST00000548132	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
GCN1-204	ENST00000548132	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GCN1-204	ENST00000548132	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
GCN1-204	ENST00000548132	FAM136A	Q96C01	138 aa		11.95	□□□□□ -0.5

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