RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534284.1

CYCSP28-201, Transcript of cytochrome c, somatic pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene CYCSP28, Length 321 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYCSP28-201ENST00000534284 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 BTBD19C9JJ37 291 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 F5H697 171 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 H3BNX3 289 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 M0QYT0 321 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 M0QZ92 97 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 PDLIM1O00151 329 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 CYB561D2O14569 222 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 ZNF195O14628 629 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 BUD23O43709 281 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 CACNG3O60359 315 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 B4GALT3O60512 393 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 UGT1A9O60656 530 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 PIAS1O75925 651 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 TNFAIP8O95379 198 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 RBP1P09455 135 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 INHBBP09529 407 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 SLC2A3P11169 496 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 STMN1P16949 149 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 ERCC2P18074 760 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 VCLP18206 1134 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 ITGAXP20702 1163 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 CCNCP24863 283 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 ADORA2AP29274 412 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 SERPINA4P29622 427 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 NTSR1P30989 418 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 RPL5P46777 297 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 CPA2P48052 419 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 PSMD8P48556 350 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 CXCR3P49682 368 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 ATP4BP51164 291 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 SLC12A2P55011 1212 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 NR1H2P55055 460 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 DAOAP59103 153 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 PPP2CBP62714 309 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 PPP2CAP67775 309 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 FKBP1BP68106 108 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 NHLH2Q02577 135 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 ADIGQ0VDE8 80 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 KLF10Q13118 480 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 PRKG2Q13237 762 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 ART3Q13508 389 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 CUL3Q13618 768 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 CCNIQ14094 377 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 FLOT2Q14254 428 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 TRIP10Q15642 601 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 CNGA3Q16281 694 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 FAM83EQ2M2I3 478 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 LIN52Q52LA3 116 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 RAB41Q5JT25 222 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 CERCAMQ5T4B2 595 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 AGAP9Q5VTM2 703 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 PM20D1Q6GTS8 502 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 PRMT9Q6P2P2 845 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 HACD2Q6Y1H2 254 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 RAPH1Q70E73 1250 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 ANKRD23Q86SG2 305 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 DEFB107AQ8IZN7 70 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 D2HGDHQ8N465 521 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 MARVELD2Q8N4S9 558 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 CCDC185Q8N715 623 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 OR6J1Q8NGC5 347 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 OR52N2Q8NGI0 321 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 POC1BQ8TC44 478 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 TRPC4APQ8TEL6 797 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 GDPD5Q8WTR4 605 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 PEX13Q92968 403 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 ZUFSPQ96AP4 578 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 SMARCD1Q96GM5 515 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 FCRL5Q96RD9 977 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 HAPLN3Q96S86 360 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 LGMNQ99538 433 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 HAUS8Q9BT25 410 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 MED10Q9BTT4 135 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 SPATA16Q9BXB7 569 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 TRIM15Q9C019 465 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 MUC13Q9H3R2 512 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 RETREG1Q9H6L5 497 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 COG4Q9H9E3 785 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 UGT1A7Q9HAW7 530 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 UGT1A10Q9HAW8 530 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 UGT1A8Q9HAW9 530 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 TBC1D13Q9NVG8 400 aa4.65□□□□□ -1.67
CYCSP28-201ENST00000534284 TMEM45AQ9NWC5 275 aa4.65□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms