RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531908.5

RPS13-208, Transcript of ribosomal protein S13, human

TSL 2

Gene RPS13, Length 746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS13-208	ENST00000531908	MYH1	P12882	1939 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	LAMB1	P07942	1786 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908		A0A087WWV3	80 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	PRSS44	E7EML9	344 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	ZBTB5	O15062	677 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	GH2	P01242	217 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	DGKA	P23743	735 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	NR2F2	P24468	414 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	ACADL	P28330	430 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	PRPH	P41219	470 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF75D	P51815	510 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	CTSC	P53634	463 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	NAPA	P54920	295 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	MFAP4	P55083	255 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	CLDN20	P56880	219 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	PLIN5	Q00G26	463 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	EPS8	Q12929	822 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	PNOC	Q13519	176 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	MEA1	Q16626	185 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	ACCSL	Q4AC99	568 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	RAB41	Q5JT25	222 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63	1e-323	■■■■■ 542.1
RPS13-208	ENST00000531908	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	NRROS	Q86YC3	692 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	SLC5A8	Q8N695	610 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	CD101	Q93033	1021 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	EPYC	Q99645	322 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	TEX12	Q9BXU0	123 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	CNTNAP1	P78357	1384 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	COL4A5	P29400	1685 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908		A0A1B0GUV1	79 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908		A0A1W2PS18	150 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	CLRN2	A0PK11	232 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	ZNHIT1	O43257	154 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	BUB3	O43684	328 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	WDR1	O75083	606 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	LDB3	O75112	727 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	KRT36	O76013	467 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	NDUFB10	O96000	172 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	CSH1	P0DML2	217 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	CSH2	P0DML3	217 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	CDH1	P12830	882 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	MYOD1	P15172	320 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF23	P17027	643 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	GCH1	P30793	250 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	SLC1A4	P43007	532 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	PRELP	P51888	382 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	MLLT10	P55197	1068 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	SNX16	P57768	344 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	ERVFC1-1	P60608	527 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	ACVR2B	Q13705	512 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	PDIA5	Q14554	519 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	CCDC96	Q2M329	555 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	LCN10	Q6JVE6	187 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	SZRD1	Q7Z422	152 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	SATL1	Q86VE3	508 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	TMEM219	Q86XT9	240 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	IQUB	Q8NA54	791 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	MLKL	Q8NB16	471 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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