RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 DAOAP59103 153 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 GABARAPL2P60520 117 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 ST8SIA6P61647 398 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 CLCA4Q14CN2 919 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 KIF19Q2TAC6 998 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 VN1R5Q7Z5H4 357 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 FAM131BQ86XD5 332 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 SH3KBP1Q96B97 665 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 ROPN1LQ96C74 230 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 VWCEQ96DN2 955 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 PHOX2BQ99453 314 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 C17orf62Q9BQA9 187 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 BDH2Q9BUT1 245 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 ALG2Q9H553 416 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 RNF167Q9H6Y7 350 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 MEAF6Q9HAF1 191 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 TDP1Q9NUW8 608 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 ERVK13-1Q9NX77 482 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 SLAMF8Q9P0V8 285 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 TLK1Q9UKI8 766 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 H0Y626 953 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 BNIP3LO60238 219 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 HOXA9P31269 272 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 CD83Q01151 205 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 GPR50Q13585 617 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 IRF3Q14653 427 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 CCDC14Q49A88 953 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 SMYD5Q6GMV2 418 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 GPR153Q6NV75 609 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 GPR149Q86SP6 731 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 EHD3Q9NZN3 535 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 METTL15A6NJ78 407 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 MDM4O15151 490 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 LINC01565O15544 149 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 PGLSO95336 258 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 PRKACGP22612 351 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 TPI1P60174 286 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 ADAM15Q13444 863 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 USP10Q14694 798 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 SYT16Q17RD7 645 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 TYSND1Q2T9J0 566 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 PARP15Q460N3 678 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 TPGS1Q6ZTW0 290 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 KCTD13Q8WZ19 329 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 LRRC58Q96CX6 371 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 GPR78Q96P69 363 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 NPAP1Q9NZP6 1156 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 TBC1D24Q9ULP9 559 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 SCML2Q9UQR0 700 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 EPN2O95208 641 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 NFATC1O95644 943 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 HRH2P25021 359 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 TRAF3Q13114 568 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 PNCKQ6P2M8 343 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 DENND1CQ8IV53 801 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 CEP97Q8IW35 865 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 BPIFB1Q8TDL5 484 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 SH3RF2Q8TEC5 729 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 FRS2Q8WU20 508 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 OVCA2Q8WZ82 227 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 FERD3LQ96RJ6 166 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 UCK2Q9BZX2 261 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 SEPT10Q9P0V9 454 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 UTS2RQ9UKP6 389 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 OR5K3A6NET4 321 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 EPOPA6NHQ4 379 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 FADS2P1A8MWK0 482 aa9.87□□□□□ -0.83
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