RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515749.1

SEC31A-241, Transcript of SEC31 homolog A, COPII coat complex component, humanhuman

TSL 2

Gene SEC31A, Length 829 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31A-241ENST00000515749 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 FIS1Q9Y3D6 152 aa7.32□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa7.32□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 LAMA3Q16787 3333 aa7.32□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 ANTXRLA6NF34 631 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 ARHGEF33A8MVX0 844 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 NPIPB8E9PQR5 432 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 PPP6CO00743 305 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 FPGTO14772 594 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 TNFRSF10CO14798 259 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 PIP5K1BO14986 540 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 RGS14O43566 566 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 MGRN1O60291 552 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 KDM1AO60341 852 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 OR4F21O95013 312 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 C1orf105O95561 183 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 APBB3O95704 486 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 PCCBP05166 539 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 JUNP05412 331 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 CAPN1P07384 714 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 KRT16P08779 473 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 TSPAN8P19075 237 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 ACADLP28330 430 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 HNF4AP41235 474 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 CASP2P42575 452 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 TPMTP51580 245 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 PNLIPRP1P54315 467 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 FOXA1P55317 472 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 KIAA1024LP59773 190 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 YPEL5P62699 121 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 ERVK-8P63133 956 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 MXRA7P84157 204 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 CTBSQ01459 385 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 PTK2BQ14289 1009 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 IRF4Q15306 451 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 RPS6KA2Q15349 733 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 PTCHD3Q3KNS1 767 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 XKR7Q5GH72 579 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 COQ5Q5HYK3 327 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 WASHC2DQ5SRD0 308 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 AGTRAPQ6RW13 159 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 C16orf89Q6UX73 402 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 SYT13Q7L8C5 426 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 C11orf96Q7Z7L8 435 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 PDZD3Q86UT5 571 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 LONP2Q86WA8 852 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 ZNF547Q8IVP9 402 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 C10orf67Q8IYJ2 551 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 MIER2Q8N344 545 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 CDYL2Q8N8U2 506 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 L3MBTL4Q8NA19 623 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 KYQ8NBH2 561 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 PLA2G15Q8NCC3 412 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 OR52B6Q8NGF0 335 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 OR9A1PQ8NGU1 263 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 OR56A3Q8NH54 315 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 CFAP61Q8NHU2 1237 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 ESAMQ96AP7 390 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 RAD51AP1Q96B01 352 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 PPP3R2Q96LZ3 170 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 MIPEPQ99797 713 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 APOOQ9BUR5 198 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 SLC25A23Q9BV35 468 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 PCBD2Q9H0N5 130 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 OR52A5Q9H2C5 316 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 ACTR8Q9H981 624 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 GULP1Q9UBP9 304 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 POLG2Q9UHN1 485 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 ZNF225Q9UK10 706 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 SNX6Q9UNH7 406 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 DMTF1Q9Y222 760 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 TMEM202A6NGA9 273 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 SHISA7A6NL88 538 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 BBIP1A8MTZ0 92 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 C10orf142B7Z368 130 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 CLGNO14967 610 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 PI15O43692 258 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 ZNF217O75362 1048 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 NPPAP01160 153 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 LMNAP02545 664 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 ASGR2P07307 311 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 LINC00032P0C843 101 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 CHRNB1P11230 501 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 HSD3B1P14060 373 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 ACPPP15309 386 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 FOSL2P15408 326 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 GNAZP19086 355 aa7.3□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms