RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514275.5

IFT122-231, Transcript of intraflagellar transport 122, human

TSL 5

Gene IFT122, Length 296 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IFT122-231	ENST00000514275	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	C1orf109	Q9NX04	203 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	SPG21	Q9NZD8	308 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	VAPA	Q9P0L0	249 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	OPTC	Q9UBM4	332 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	CDH7	Q9ULB5	785 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	PDE10A	Q9Y233	779 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	CPQ	Q9Y646	472 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275		A0A096LPI6	279 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	CCDC160	A6NGH7	325 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275		A8MX80	341 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	FFAR3	O14843	346 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	WNT9A	O14904	365 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	CLGN	O14967	610 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	AREL1	O15033	823 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	TEX28	O15482	410 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	GPR42	O15529	346 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	EFS	O43281	561 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	SGTA	O43765	313 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	NUAK1	O60285	661 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	PRAMEF4	O60810	478 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	SEC22B	O75396	215 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	GMNN	O75496	209 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	STK16	O75716	305 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	GUCA1C	O95843	209 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	HPR	P00739	348 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	KRT6A	P02538	564 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	KRT6B	P04259	564 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	PRPS2	P11908	318 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	SRC	P12931	536 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	PFKL	P17858	780 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	AKT1	P31749	480 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	CCR7	P32248	378 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	SHMT2	P34897	504 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	NSG1	P42857	185 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	SLC6A12	P48065	614 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	KRT6C	P48668	564 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	PIK3CG	P48736	1102 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	SPINT3	P49223	89 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	HLCS	P50747	726 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	ALDH3A2	P51648	485 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	ARSF	P54793	590 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	MTPN	P58546	118 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	ESRRG	P62508	458 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	HMGCS1	Q01581	520 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	SEMG2	Q02383	582 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	TLE2	Q04725	743 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	CYP4F3	Q08477	520 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	PMS2P3	Q13401	168 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	CDH18	Q13634	790 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	GRIN2C	Q14957	1233 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	PYCR3	Q53H96	274 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	CARD16	Q5EG05	197 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	SGO1	Q5FBB7	561 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	GAREM2	Q75VX8	874 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	GPR141	Q7Z602	305 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	GPR149	Q86SP6	731 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT122-231	ENST00000514275	GPR180	Q86V85	440 aa		4.86	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms