RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 CX3CL1P78423 397 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-205ENST00000514178 FOLH1Q04609 750 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-205ENST00000514178 DMPKQ09013 629 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-205ENST00000514178 DLG1Q12959 904 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-205ENST00000514178 RPS6KA1Q15418 735 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-205ENST00000514178 PTGISQ16647 500 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-205ENST00000514178 FUT11Q495W5 492 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-205ENST00000514178 PARP10Q53GL7 1025 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-205ENST00000514178 PODNL1Q6PEZ8 512 aa7.28□□□□□ -1.24
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PGGT1B-205ENST00000514178 PIGWQ7Z7B1 504 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-205ENST00000514178 CNTN4Q8IWV2 1026 aa7.28□□□□□ -1.24
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PGGT1B-205ENST00000514178 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-205ENST00000514178 ODF2LQ9ULJ1 636 aa7.28□□□□□ -1.24
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PGGT1B-205ENST00000514178 VDAC3Q9Y277 283 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-205ENST00000514178 WDR83OSQ9Y284 106 aa7.28□□□□□ -1.24
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PGGT1B-205ENST00000514178 CLEC18AA5D8T8 446 aa7.27□□□□□ -1.25
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PGGT1B-205ENST00000514178 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PGGT1B-205ENST00000514178 CTDSPLO15194 276 aa7.27□□□□□ -1.25
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PGGT1B-205ENST00000514178 TTI1O43156 1089 aa7.27□□□□□ -1.25
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PGGT1B-205ENST00000514178 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF425Q6IV72 752 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM171BQ6P995 826 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1B-205ENST00000514178 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1B-205ENST00000514178 KMT5CQ86Y97 462 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1B-205ENST00000514178 SIAH3Q8IW03 269 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1B-205ENST00000514178 CCDC83Q8IWF9 413 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1B-205ENST00000514178 APCDD1Q8J025 514 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1B-205ENST00000514178 PELI3Q8N2H9 469 aa7.27□□□□□ -1.25
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PGGT1B-205ENST00000514178 NCOA7Q8NI08 942 aa7.27□□□□□ -1.25
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PGGT1B-205ENST00000514178 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1B-205ENST00000514178 SNX25Q9H3E2 840 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1B-205ENST00000514178 Q9H8V8 135 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM161AQ9NX61 479 aa7.27□□□□□ -1.25
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PGGT1B-205ENST00000514178 WNT16Q9UBV4 365 aa7.27□□□□□ -1.25
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PGGT1B-205ENST00000514178 I3L1I5 382 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
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PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF415Q09FC8 603 aa7.26□□□□□ -1.25
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PGGT1B-205ENST00000514178 C11orf87Q6NUJ2 197 aa7.26□□□□□ -1.25
PGGT1B-205ENST00000514178 LONP2Q86WA8 852 aa7.26□□□□□ -1.25
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PGGT1B-205ENST00000514178 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa7.26□□□□□ -1.25
PGGT1B-205ENST00000514178 PSMA8Q8TAA3 256 aa7.26□□□□□ -1.25
PGGT1B-205ENST00000514178 ST7LQ8TDW4 575 aa7.26□□□□□ -1.25
PGGT1B-205ENST00000514178 IRGQQ8WZA9 623 aa7.26□□□□□ -1.25
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PGGT1B-205ENST00000514178 LINGO1Q96FE5 620 aa7.26□□□□□ -1.25
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM237Q96Q45 408 aa7.26□□□□□ -1.25
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PGGT1B-205ENST00000514178 TTC3P53804 2025 aa7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-205ENST00000514178 TRAV24A0A0B4J272 114 aa7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-205ENST00000514178 MAGEA13PA6NCF6 341 aa7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-205ENST00000514178 CASTOR2A6NHX0 329 aa7.25□□□□□ -1.25
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PGGT1B-205ENST00000514178 C8orf89P0DMQ9 161 aa7.25□□□□□ -1.25
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PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF23P17027 643 aa7.25□□□□□ -1.25
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PGGT1B-205ENST00000514178 HMGA2P52926 109 aa7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-205ENST00000514178 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-205ENST00000514178 RPS18P62269 152 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-205ENST00000514178 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-205ENST00000514178 PPA1Q15181 289 aa7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-205ENST00000514178 SUSD4Q5VX71 490 aa7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-205ENST00000514178 BTNL8Q6UX41 500 aa7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-205ENST00000514178 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-205ENST00000514178 DNAJC10Q8IXB1 793 aa7.25□□□□□ -1.25
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