RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514110.5

SNHG4-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 4, human

TSL 1 (best)

Gene SNHG4, Length 679 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG4-208	ENST00000514110	RAB28	P51157	221 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	GRB7	Q14451	532 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	MYBPC3	Q14896	1274 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	C4orf17	Q53FE4	359 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	KRT222	Q8N1A0	295 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	GALNT16	Q8N428	558 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	PTER	Q96BW5	349 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	IL17F	Q96PD4	163 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	TTC1	Q99614	292 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	NDC1	Q9BTX1	674 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	CARD6	Q9BX69	1037 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	C5AR2	Q9P296	337 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	SEC16A	O15027	2179 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110		E7EVH7	732 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	PEX12	O00623	359 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	CD63	P08962	238 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	ALAS2	P22557	587 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	AOAH	P28039	575 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	GRIA3	P42263	894 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	PRAME	P78395	509 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	SNX1	Q13596	522 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	FCRL6	Q6DN72	434 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110		F8W8V4	182 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	SLCO2B1	O94956	709 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	IGHE	P01854	428 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	RPN2	P04844	631 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	APRT	P07741	180 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	CD9	P21926	228 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	MCM3	P25205	808 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	SOX8	P57073	446 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	CRADD	P78560	199 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	NR6A1	Q15406	480 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	COX15	Q7KZN9	410 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	IQCK	Q8N0W5	287 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	PRR7	Q8TB68	274 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	DLG3	Q92796	817 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	INPP5D	Q92835	1189 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110		A0A1B0GX78	115 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	KRT87P	A6NCN2	255 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	AGPS	O00116	658 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	RASGRF2	O14827	1237 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	ALOX12B	O75342	701 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	CBX6	O95503	412 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	ONECUT2	O95948	504 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	S1PR4	O95977	384 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	ALPP	P05187	535 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	APOA4	P06727	396 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	ARSF	P54793	590 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SNHG4-208	ENST00000514110	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms