RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509876.5

PHF3-210, Transcript of PHD finger protein 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PHF3, Length 7,124 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3-210ENST00000509876 DYTNA2CJ06 578 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 NPHS1O60500 1241 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 B4GALT3O60512 393 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 OR2B3O76000 313 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 PGDP52209 483 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 ZXDAP98168 799 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 RAB6CQ53S08 254 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 Q6ZNB5 142 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 ASPGQ86U10 573 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 ZNF563Q8TA94 476 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 TMEM125Q96AQ2 219 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 VN1R3Q9BXE9 311 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 RAB6CQ9H0N0 254 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 FANCFQ9NPI8 374 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 FADS3Q9Y5Q0 445 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 ACTL7AQ9Y615 435 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 FAM159BA6NKW6 160 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 FAM220BPB1ANY3 271 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 AGPSO00116 658 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 PDPK1O15530 556 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 ERI3O43414 337 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 SERPINB7O75635 380 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 LRATO95237 230 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 KLKB1P03952 638 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 BPGMP07738 259 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 UMPSP11172 480 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 PRPS2P11908 318 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 CASP6P55212 293 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 TBC1D25Q3MII6 688 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 SCIMPQ6UWF3 145 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 USP53Q70EK8 1073 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 TDRPQ86YL5 185 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 CLEC4FQ8N1N0 589 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 CLDN19Q8N6F1 224 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 KYQ8NBH2 561 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 ACVR1CQ8NER5 493 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 RIN3Q8TB24 985 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 TWIST2Q8WVJ9 160 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 FIG4Q92562 907 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 C19orf60Q96EN9 201 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 PANX1Q96RD7 426 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 DHRS7Q9Y394 339 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 TNFRSF10AO00220 468 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 HDAC3O15379 428 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 COQ9O75208 318 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 S1PR4O95977 384 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 IGHEP01854 428 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 TCF3P15923 654 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 MAOBP27338 520 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 RPL34P49207 117 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 CDH13P55290 713 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 KIAA1024LP59773 190 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 HERVK_113P63132 956 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 NFKB2Q00653 900 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 FCHO2Q0JRZ9 810 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 FLOT2Q14254 428 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 HERC3Q15034 1050 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 PPM1JQ5JR12 505 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 TRABD2AQ86V40 505 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 AADATQ8N5Z0 425 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 SLC6A18Q96N87 628 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 C1orf50Q9BV19 199 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 ERVK-6Q9BXR3 956 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 TRPV4Q9HBA0 871 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 KRT87PA6NCN2 255 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 E7EQ34 232 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 MYO1CO00159 1063 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 TGDSO95455 350 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 GRK6P43250 576 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 PRSS36Q5K4E3 855 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 SYCE2Q6PIF2 218 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 NRBF2Q96F24 287 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 THTPAQ9BU02 230 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 XKR8Q9H6D3 395 aa5□□□□□ -1.61
PHF3-210ENST00000509876 HCN2Q9UL51 889 aa5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms