RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504971.1

FBXO38-208, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 3

Gene FBXO38, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-208	ENST00000504971	USP45	Q70EL2	814 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	GPR65	Q8IYL9	337 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	SCML4	Q8N228	414 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	BEST2	Q8NFU1	509 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	INTS14	Q96SY0	518 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	ZSCAN5A	Q9BUG6	496 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	EBF2	Q9HAK2	575 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	CISH	Q9NSE2	258 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	PARVA	Q9NVD7	372 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971		A0A0U1RQF3	1178 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971		A0A0U1RQS6	177 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971		F8W735	103 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971		H3BNC9	293 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	ARVCF	O00192	962 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	PIR	O00625	290 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	TSPAN4	O14817	238 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	CILP	O75339	1184 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	SERPINB7	O75635	380 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	CLPX	O76031	633 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	MOCS3	O95396	460 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	MT-ATP6	P00846	226 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	APOC1	P02654	83 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	IFNA16	P05015	189 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	MMP2	P08253	660 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC2A3	P11169	496 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	CTSS	P25774	331 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	KHK	P50053	298 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	IST1	P53990	364 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	NOMO3	P69849	1222 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	GPC5	P78333	572 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	PHC1	P78364	1004 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	RAD51	Q06609	339 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	DAG1	Q14118	895 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	NTRK2	Q16620	822 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	PGS1	Q32NB8	556 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	P3H1	Q32P28	736 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	SV2C	Q496J9	727 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	PMF1	Q6P1K2	205 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	TMEM270	Q6UE05	265 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	UNC93A	Q86WB7	457 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	PALB2	Q86YC2	1186 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	ST7L	Q8TDW4	575 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	GLMP	Q8WWB7	406 aa		6.62	□□□□□ -1.35

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