RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492741.5

PSPC1-204, Transcript of paraspeckle component 1, humanhuman

TSL 2

Gene PSPC1, Length 1,709 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1-204ENST00000492741 GMEB2Q9UKD1 530 aa21.4■■□□□ 1.02
PSPC1-204ENST00000492741 PCTPQ9UKL6 214 aa21.4■■□□□ 1.02
PSPC1-204ENST00000492741 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa21.4■■□□□ 1.02
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF839A8K0R7 811 aa21.39■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 K7EPI3 171 aa21.39■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 E2F3O00716 465 aa21.39■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 SNNO75324 88 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 HSD17B2P37059 387 aa21.39■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 GTF2H2Q13888 395 aa21.39■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 GRB7Q14451 532 aa21.39■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 RBBP7Q16576 425 aa21.39■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF423Q2M1K9 1284 aa21.39■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa21.39■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 SFTPA2Q8IWL1 248 aa21.39■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 SFRP1Q8N474 314 aa21.39■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 SNX31Q8N9S9 440 aa21.39■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 OR52E1Q8NGJ3 308 aa21.39■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 ATP6V1E2Q96A05 226 aa21.39■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 TRMOQ9BU70 441 aa21.39■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 C20orf27Q9GZN8 174 aa21.39■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa21.39■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 SPATA7Q9P0W8 599 aa21.39■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa21.39■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 A0A1B0GTQ1 180 aa21.38■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 ARHGAP33O14559 1287 aa21.38■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 GIPC1O14908 333 aa21.38■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 CHRNGP07510 517 aa21.38■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 EPB42P16452 691 aa21.38■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 ARHGAP19Q14CB8 494 aa21.38■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 PLCL1Q15111 1095 aa21.38■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa21.38■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 CRLF3Q8IUI8 442 aa21.38■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa21.38■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 SH3KBP1Q96B97 665 aa21.38■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa21.38■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 XKR8Q9H6D3 395 aa21.38■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa21.38■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 POT1Q9NUX5 634 aa21.38■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 SLC22A14Q9Y267 594 aa21.38■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 CER1O95813 267 aa21.38■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 MLYCDO95822 493 aa21.38■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 OCRLQ01968 901 aa21.38■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 HHEXQ03014 270 aa21.38■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 SHBQ15464 509 aa21.38■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa21.38■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa21.38■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 CPLX4Q7Z7G2 160 aa21.38■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 LCN9Q8WX39 176 aa21.38■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 EPN3Q9H201 632 aa21.38■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 SMOC1Q9H4F8 434 aa21.38■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 RABEP2Q9H5N1 569 aa21.38■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 SLC40A1Q9NP59 571 aa21.38■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 DNAJC11Q9NVH1 559 aa21.38■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 PI4KAP42356 2102 aa21.37■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 YKT6O15498 198 aa21.37■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 EDF1O60869 148 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 ARRB2P32121 409 aa21.37■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 SLC6A12P48065 614 aa21.37■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 PIK3CGP48736 1102 aa21.37■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 RAB28P51157 221 aa21.37■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 LAIR1Q6GTX8 287 aa21.37■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 SUSD1Q6UWL2 747 aa21.37■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 SLC25A45Q8N413 288 aa21.37■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 OR56A3Q8NH54 315 aa21.37■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 AGR3Q8TD06 166 aa21.37■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 C7orf26Q96N11 449 aa21.37■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 NRTNQ99748 197 aa21.37■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 IPPKQ9H8X2 491 aa21.37■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 IL21RQ9HBE5 538 aa21.37■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 E7ENX8 843 aa21.36■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 KATNA1O75449 491 aa21.36■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 KITP10721 976 aa21.36■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 TBPL1P62380 186 aa21.36■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 TAP2Q03519 686 aa21.36■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 LCP2Q13094 533 aa21.36■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 LSMEM2Q8N112 164 aa21.36■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 AVL9Q8NBF6 648 aa21.36■■□□□ 1.01
PSPC1-204ENST00000492741 OR4E2Q8NGC2 313 aa21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms