RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486388.5

UBP1-210, Transcript of upstream binding protein 1, human

TSL 3

Gene UBP1, Length 928 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBP1-210	ENST00000486388	POLQ	O75417	2590 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ESPL1	Q14674	2120 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388		A0A0U1RQS6	177 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	MYO1F	O00160	1098 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	MATN2	O00339	956 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	EPHB6	O15197	1021 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF185	O15231	689 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	MATN3	O15232	486 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	JCHAIN	P01591	159 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	HBQ1	P09105	142 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	PYGM	P11217	842 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	FOLR1	P15328	257 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	CD247	P20963	164 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	NDUFS1	P28331	727 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	TNFRSF8	P28908	595 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	HOXC12	P31275	282 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	AKT1	P31749	480 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	DCT	P40126	519 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	VAV2	P52735	878 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	RIPPLY3	P57055	190 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	DCDC1	P59894	354 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	TUBB4B	P68371	445 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	MYL5	Q02045	173 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	DSC2	Q02487	901 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	GALNT2	Q10471	571 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	MAP4K2	Q12851	820 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	CHAF1B	Q13112	559 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	TUBB2A	Q13885	445 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	KCNAB1	Q14722	419 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	NR1I3	Q14994	352 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	PTPRR	Q15256	657 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ASIC2	Q16515	512 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	CPZ	Q66K79	652 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	RPTN	Q6XPR3	784 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	AMZ2	Q86W34	360 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	GPR135	Q8IZ08	494 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	KCTD6	Q8NC69	237 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	COG1	Q8WTW3	980 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	RSC1A1	Q92681	617 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	FATE1	Q969F0	183 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	RNF31	Q96EP0	1072 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	VPS50	Q96JG6	964 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	TSGA13	Q96PP4	275 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	AGAP2	Q99490	1192 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	NLN	Q9BYT8	704 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ANO10	Q9NW15	660 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	HEBP2	Q9Y5Z4	205 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	HEATR9	A2RTY3	570 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	CHUK	O15111	745 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	CBFA2T2	O43439	604 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	PRAMEF1	O95521	474 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	PEX11B	O96011	259 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	EBLN1	P0CF75	366 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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