RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482439.6

TBC1D15-208, Transcript of TBC1 domain family member 15, human

TSL 5

Gene TBC1D15, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBC1D15-208	ENST00000482439	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
TBC1D15-208	ENST00000482439	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
TBC1D15-208	ENST00000482439	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TBC1D15-208	ENST00000482439	OPTC	Q9UBM4	332 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TBC1D15-208	ENST00000482439	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
TBC1D15-208	ENST00000482439	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
TBC1D15-208	ENST00000482439	PLAGL1	Q9UM63	463 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TBC1D15-208	ENST00000482439	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
TBC1D15-208	ENST00000482439	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
TBC1D15-208	ENST00000482439	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TBC1D15-208	ENST00000482439	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
TBC1D15-208	ENST00000482439	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TBC1D15-208	ENST00000482439	TMEM233	B4DJY2	109 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TBC1D15-208	ENST00000482439		E7ENX8	843 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TBC1D15-208	ENST00000482439	MATN2	O00339	956 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TBC1D15-208	ENST00000482439	PRAMEF4	O60810	478 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TBC1D15-208	ENST00000482439	WDR47	O94967	919 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TBC1D15-208	ENST00000482439	MLYCD	O95822	493 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TBC1D15-208	ENST00000482439	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	13.65	□□□□□ -0.22
TBC1D15-208	ENST00000482439	F3	P13726	295 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TBC1D15-208	ENST00000482439	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
TBC1D15-208	ENST00000482439	HAL	P42357	657 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TBC1D15-208	ENST00000482439	CTSK	P43235	329 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TBC1D15-208	ENST00000482439	PNLIPRP1	P54315	467 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TBC1D15-208	ENST00000482439	C21orf59	P57076	290 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TBC1D15-208	ENST00000482439	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TBC1D15-208	ENST00000482439	TAP2	Q03519	686 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TBC1D15-208	ENST00000482439	TEAD4	Q15561	434 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TBC1D15-208	ENST00000482439	KIF19	Q2TAC6	998 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TBC1D15-208	ENST00000482439	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TBC1D15-208	ENST00000482439	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TBC1D15-208	ENST00000482439	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
TBC1D15-208	ENST00000482439	LRRC70	Q7Z2Q7	622 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TBC1D15-208	ENST00000482439	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TBC1D15-208	ENST00000482439	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TBC1D15-208	ENST00000482439	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TBC1D15-208	ENST00000482439	C10orf82	Q8WW14	230 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TBC1D15-208	ENST00000482439	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TBC1D15-208	ENST00000482439	OR4K3	Q96R72	315 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TBC1D15-208	ENST00000482439	ZNF382	Q96SR6	550 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TBC1D15-208	ENST00000482439	SGPP1	Q9BX95	441 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TBC1D15-208	ENST00000482439	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TBC1D15-208	ENST00000482439	IPPK	Q9H8X2	491 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TBC1D15-208	ENST00000482439	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TBC1D15-208	ENST00000482439	POLG2	Q9UHN1	485 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TBC1D15-208	ENST00000482439	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TBC1D15-208	ENST00000482439	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TBC1D15-208	ENST00000482439	HEBP2	Q9Y5Z4	205 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TBC1D15-208	ENST00000482439	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TBC1D15-208	ENST00000482439	PCM1	Q15154	2024 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TBC1D15-208	ENST00000482439	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TBC1D15-208	ENST00000482439	ESRRB	O95718	433 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TBC1D15-208	ENST00000482439	GNS	P15586	552 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TBC1D15-208	ENST00000482439	EPB42	P16452	691 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TBC1D15-208	ENST00000482439	NPPB	P16860	134 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TBC1D15-208	ENST00000482439	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
TBC1D15-208	ENST00000482439	FOXA1	P55317	472 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TBC1D15-208	ENST00000482439	PKNOX1	P55347	436 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TBC1D15-208	ENST00000482439	PCDH1	Q08174	1060 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TBC1D15-208	ENST00000482439	TRAF3	Q13114	568 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TBC1D15-208	ENST00000482439	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TBC1D15-208	ENST00000482439	RBBP7	Q16576	425 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TBC1D15-208	ENST00000482439	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TBC1D15-208	ENST00000482439	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
TBC1D15-208	ENST00000482439	CEP68	Q76N32	757 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TBC1D15-208	ENST00000482439	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
TBC1D15-208	ENST00000482439	SYT12	Q8IV01	421 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TBC1D15-208	ENST00000482439	CLYBL	Q8N0X4	340 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TBC1D15-208	ENST00000482439	AGR3	Q8TD06	166 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TBC1D15-208	ENST00000482439	MAPK15	Q8TD08	544 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TBC1D15-208	ENST00000482439	LMX1A	Q8TE12	382 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TBC1D15-208	ENST00000482439	PIGK	Q92643	395 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TBC1D15-208	ENST00000482439	NTMT1	Q9BV86	223 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TBC1D15-208	ENST00000482439	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TBC1D15-208	ENST00000482439	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TBC1D15-208	ENST00000482439	SPAST	Q9UBP0	616 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TBC1D15-208	ENST00000482439	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TBC1D15-208	ENST00000482439	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TBC1D15-208	ENST00000482439	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TBC1D15-208	ENST00000482439	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TBC1D15-208	ENST00000482439	PI4KA	P42356	2102 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TBC1D15-208	ENST00000482439	HDAC3	O15379	428 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TBC1D15-208	ENST00000482439	YY2	O15391	372 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TBC1D15-208	ENST00000482439	GFRA3	O60609	400 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TBC1D15-208	ENST00000482439	OR4F21	O95013	312 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TBC1D15-208	ENST00000482439	SERPINB3	P29508	390 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TBC1D15-208	ENST00000482439	HSD17B2	P37059	387 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TBC1D15-208	ENST00000482439	RXRG	P48443	463 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TBC1D15-208	ENST00000482439	PIK3CG	P48736	1102 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TBC1D15-208	ENST00000482439	IDH3A	P50213	366 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TBC1D15-208	ENST00000482439	HK2	P52789	917 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TBC1D15-208	ENST00000482439	AQP5	P55064	265 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TBC1D15-208	ENST00000482439	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	13.63	□□□□□ -0.23
TBC1D15-208	ENST00000482439	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TBC1D15-208	ENST00000482439	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TBC1D15-208	ENST00000482439	KRT33B	Q14525	404 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TBC1D15-208	ENST00000482439	ELOC	Q15369	112 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TBC1D15-208	ENST00000482439	SHB	Q15464	509 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TBC1D15-208	ENST00000482439	CLEC6A	Q6EIG7	209 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TBC1D15-208	ENST00000482439	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		13.63	□□□□□ -0.23

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms