RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 A0A0J9YY10 115 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 ARHGEF33A8MVX0 844 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 K7ENP7 123 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 KIAA0754O94854 1291 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 MPC1LP0DKB6 136 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 CBSLP0DN79 551 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
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ACTB-211ENST00000480301 CBSP35520 551 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 CDKN2DP55273 166 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 VAC14Q08AM6 782 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 MGAT5Q09328 741 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 ZIC1Q15915 447 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 ARHGAP40Q5TG30 622 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 C8orf74Q6P047 294 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 MMGT1Q8N4V1 131 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 MAGEC3Q8TD91 643 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 FCRL4Q96PJ5 515 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 PSAT1Q9Y617 370 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa20.22■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 WT1P19544 449 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 MAP7Q14244 749 aa20.22■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 UGT3A1Q6NUS8 523 aa20.22■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa20.22■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 TAX1BP1Q86VP1 789 aa20.22■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 FAM20CQ8IXL6 584 aa20.22■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 CPNE9Q8IYJ1 553 aa20.22■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 IL22RA1Q8N6P7 574 aa20.22■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 OR8K5Q8NH50 307 aa20.22■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 HMGCLL1Q8TB92 370 aa20.22■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 ASB11Q8WXH4 323 aa20.22■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 SEC14L1Q92503 715 aa20.22■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 SYTL2Q9HCH5 934 aa20.22■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 FAM60AQ9NP50 221 aa20.22■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 SMYD2Q9NRG4 433 aa20.22■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 TAS2R13Q9NYV9 303 aa20.22■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 SPATA7Q9P0W8 599 aa20.22■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 ZFATQ9P243 1243 aa20.22■□□□□ 0.83
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ACTB-211ENST00000480301 GFYI3L273 518 aa20.21■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 MYO1CO00159 1063 aa20.21■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 MSL3P1P0C860 447 aa20.21■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 MCM3P25205 808 aa20.21■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 SSTR1P30872 391 aa20.21■□□□□ 0.83
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ACTB-211ENST00000480301 CYP2A13Q16696 494 aa20.21■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 HECTD2Q5U5R9 776 aa20.21■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 CAPN12Q6ZSI9 719 aa20.21■□□□□ 0.83
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ACTB-211ENST00000480301 ESX1Q8N693 406 aa20.21■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 GALNT6Q8NCL4 622 aa20.21■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 OR9A1PQ8NGU1 263 aa20.21■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 OR1L3Q8NH93 324 aa20.21■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 KIF18AQ8NI77 898 aa20.21■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa20.21■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 SLC22A18Q96BI1 424 aa20.21■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 TCTN2Q96GX1 697 aa20.21■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 PHACTR1Q9C0D0 580 aa20.21■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa20.21■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa20.21■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa20.2■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa20.2■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PPV9 198 aa20.2■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 CATP04040 527 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 GABRA4P48169 554 aa20.2■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 PGGT1BP53609 377 aa20.2■□□□□ 0.82
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ACTB-211ENST00000480301 ABHD18Q0P651 414 aa20.2■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 PAQR3Q6TCH7 311 aa20.2■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 SLC26A11Q86WA9 606 aa20.2■□□□□ 0.82
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ACTB-211ENST00000480301 GPATCH11Q8N954 259 aa20.2■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 MNS1Q8NEH6 495 aa20.2■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 PKP4Q99569 1192 aa20.2■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 FAM114A2Q9NRY5 505 aa20.2■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa20.2■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 KLHL20Q9Y2M5 609 aa20.2■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 VWA7Q9Y334 891 aa20.2■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 CHD6Q8TD26 2715 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 CTAGE15A4D2H0 777 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 TMEM150CB9EJG8 249 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 MAP3K7O43318 606 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 HCRTR1O43613 425 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 NTRK1P04629 796 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 CTAGE8P0CG41 777 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 ERGP11308 486 aa20.19■□□□□ 0.82
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