RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467983.1

ABCB4-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily B member 4, human

TSL 3

Gene ABCB4, Length 414 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCB4-208	ENST00000467983	PDK2	Q15119	407 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CYTH1	Q15438	398 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CCDC153	Q494R4	210 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	PIGG	Q5H8A4	983 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	STEAP4	Q687X5	459 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	EPGN	Q6UW88	154 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CYS1	Q717R9	158 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	HM13	Q8TCT9	377 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ACER1	Q8TDN7	264 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	JDP2	Q8WYK2	163 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	HSPH1	Q92598	858 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CDKL2	Q92772	493 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	BORCS5	Q969J3	196 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CNDP1	Q96KN2	507 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CEP170P1	Q96L14	293 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	PKP2	Q99959	881 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CALN1	Q9BXU9	219 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	LHX5	Q9H2C1	402 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	VPS45	Q9NRW7	570 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	HACD3	Q9P035	362 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	MID2	Q9UJV3	735 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	FZD4	Q9ULV1	537 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ZNF711	Q9Y462	761 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	DOCK1	Q14185	1865 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983		A0A087WXM4	84 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	KPNA7	A9QM74	516 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983		H3BNH8	94 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	TPP1	O14773	563 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	AIM2	O14862	343 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	MAGEB3	O15480	346 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ZBTB14	O43829	449 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	KLHL41	O60662	606 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ZMPSTE24	O75844	475 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	KRT34	O76011	436 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	TOMM70	O94826	608 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	OAZ2	O95190	189 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	STBD1	O95210	358 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	RASAL1	O95294	804 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	H6PD	O95479	791 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	HSPA4L	O95757	839 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CCNE2	O96020	404 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	HRG	P04196	525 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	APRT	P07741	180 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	FGF2	P09038	288 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	MCF2	P10911	925 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	RBL1	P28749	1068 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ALDH1B1	P30837	517 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	THOP1	P52888	689 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	PRKAA2	P54646	552 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CDH6	P55285	790 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ESRRG	P62508	458 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CDKL1	Q00532	357 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ART3	Q13508	389 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	PEX6	Q13608	980 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63

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