RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462229.1

PHF19-208, Transcript of PHD finger protein 19, human

TSL 2

Gene PHF19, Length 550 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PHF19-208	ENST00000462229	C2orf74	A8MZ97	194 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	CS	O75390	466 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	KLHL2	O95198	593 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	SLC16A8	O95907	504 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	INHBC	P55103	352 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	GFER	P55789	205 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	CLDN6	P56747	220 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	CDKL1	Q00532	357 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	DLG1	Q12959	904 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	KIR2DS3	Q14952	304 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	PHKG1	Q16816	387 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	IRGC	Q6NXR0	463 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	ISCA2	Q86U28	154 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	CENPL	Q8N0S6	344 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	CARF	Q8N187	725 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	STAG3L4	Q8TBR4	150 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	MZB1	Q8WU39	189 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	ZNF480	Q8WV37	535 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	NXNL1	Q96CM4	212 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	TGM7	Q96PF1	710 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	POMT2	Q9UKY4	750 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	OARD1	Q9Y530	152 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	SPTBN2	O15020	2390 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	PTPRB	P23467	1997 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	GSAP	A4D1B5	854 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	KRT87P	A6NCN2	255 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	SMIM23	A6NLE4	172 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	MT-ND3	P03897	115 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	THRA	P10827	490 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	GMPR	P36959	345 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	PDX1	P52945	283 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	PNLIPRP1	P54315	467 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	IRF9	Q00978	393 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	FOXC1	Q12948	553 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	13.43	□□□□□ -0.26	4e-6	■■□□□ 12.2
PHF19-208	ENST00000462229	ACAP2	Q15057	778 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	PHF19	Q5T6S3	580 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	KLC3	Q6P597	504 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	LCA5	Q86VQ0	697 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	CYP4X1	Q8N118	509 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	ATL1	Q8WXF7	558 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	SMPDL3A	Q92484	453 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	PTER	Q96BW5	349 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	GPR78	Q96P69	363 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	OR2A14	Q96R47	310 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	STRADB	Q9C0K7	418 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	ARL15	Q9NXU5	204 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	STOX2	Q9P2F5	926 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	TLCD2	A6NGC4	264 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	ISM1	B1AKI9	464 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229		E7ENX8	843 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	FKBP9	O95302	570 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	ADRB1	P08588	477 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	UGT2B7	P16662	529 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	KRT15	P19012	456 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	TFEB	P19484	476 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	MPST	P25325	297 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	IMPA1	P29218	277 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	PPP1CA	P62136	330 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	TAP2	Q03519	686 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	OR4D1	Q15615	310 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	SPESP1	Q6UW49	350 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	CLEC14A	Q86T13	490 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	CROCCP2	Q86T23	111 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF19-208	ENST00000462229	GPSM1	Q86YR5	675 aa		13.42	□□□□□ -0.26

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