RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 GALNT6Q8NCL4 622 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 OR1L3Q8NH93 324 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 CD200R1Q8TD46 325 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 ASZ1Q8WWH4 475 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 UBXN4Q92575 508 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 CFAP36Q96G28 342 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 CD180Q99467 661 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 NDNQ99608 321 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 TTC1Q99614 292 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 GPR21Q99679 349 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 ERP44Q9BS26 406 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 PITPNM3Q9BZ71 974 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 C1GALT1Q9NS00 363 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 FGF21Q9NSA1 209 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 RNF14Q9UBS8 474 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 IKZF3Q9UKT9 509 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 BTRCQ9Y297 605 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 DHRS7Q9Y394 339 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 PSAT1Q9Y617 370 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM187AA6NFU0 413 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 ARHGEF33A8MVX0 844 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 ISM1B1AKI9 464 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 RASGRF2O14827 1237 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 NKX2-8O15522 239 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 C1QL1O75973 258 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 ESR1P03372 595 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 APOA4P06727 396 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 CAPN1P07384 714 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 PGAM1P18669 254 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 CD82P27701 267 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 GMPRP36959 345 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 STAT5AP42229 794 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 TMPRSS3P57727 454 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 FOXL2P58012 376 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 GPX6P59796 221 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
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RABGEF1-206ENST00000461017 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 PRKAA1Q13131 559 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 GPS2Q13227 327 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 TUBB3Q13509 450 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 SPANXN3Q5MJ09 141 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM164Q5U3C3 297 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 BROXQ5VW32 411 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 ARMC3Q5W041 872 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 ARMC6Q6NXE6 501 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF449Q6P9G9 518 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 KLHL35Q6PF15 583 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 PAQR3Q6TCH7 311 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 SUSD1Q6UWL2 747 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC81Q6ZN84 652 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 OTOAQ7RTW8 1153 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 PPP1R3BQ86XI6 285 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 CNTN4Q8IWV2 1026 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 CPNE9Q8IYJ1 553 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 NLGN4XQ8N0W4 816 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 DNAJC22Q8N4W6 341 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 DTWD1Q8N5C7 304 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 ZBTB2Q8N680 514 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 IL22RA1Q8N6P7 574 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 EXD3Q8N9H8 876 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 PPFIBP2Q8ND30 876 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 FBXO36Q8NEA4 188 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 CERS2Q96G23 380 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 SNF8Q96H20 258 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 FCRL4Q96PJ5 515 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 PANX3Q96QZ0 392 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 PKP4Q99569 1192 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 OLFM1Q99784 485 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 LRRC1Q9BTT6 524 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 ULBP3Q9BZM4 244 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 MOCS1Q9NZB8 636 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 POLG2Q9UHN1 485 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 CROTQ9UKG9 612 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 COL6A6A6NMZ7 2263 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A0J9YY10 115 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 C2orf74A8MZ97 194 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM150CB9EJG8 249 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 GFYI3L273 518 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 URI1O94763 535 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 MED26O95402 600 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 ERGP11308 486 aa6.75□□□□□ -1.33
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