RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448062.1

RPL23AP28-201, Transcript of ribosomal protein L23a pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene RPL23AP28, Length 470 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23AP28-201ENST00000448062 LCN9Q8WX39 176 aa6.6□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 RSC1A1Q92681 617 aa6.6□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 RAD51AP1Q96B01 352 aa6.6□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 RHBDF1Q96CC6 855 aa6.6□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 PHF21BQ96EK2 531 aa6.6□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 PKNOX2Q96KN3 472 aa6.6□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 SLC38A3Q99624 504 aa6.6□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 EGFL8Q99944 293 aa6.6□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 CCDC3Q9BQI4 270 aa6.6□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 TMEM79Q9BSE2 394 aa6.6□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 RDH14Q9HBH5 336 aa6.6□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 POT1Q9NUX5 634 aa6.6□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 MKS1Q9NXB0 559 aa6.6□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 ARL15Q9NXU5 204 aa6.6□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 CD274Q9NZQ7 290 aa6.6□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 TMEM9Q9P0T7 183 aa6.6□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 FTSJ1Q9UET6 329 aa6.6□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 POLG2Q9UHN1 485 aa6.6□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 SH2B3Q9UQQ2 575 aa6.6□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 KLHL20Q9Y2M5 609 aa6.6□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa6.6□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 A0A1W2PQM1 296 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 AGRPO00253 132 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 PPP6CO00743 305 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 KLK8O60259 260 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 NRP2O60462 931 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 PRAMEF10O60809 474 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 UBXN7O94888 489 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 RPN2P04844 631 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 PROS1P07225 676 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 RBP1P09455 135 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 ERGP11308 486 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 GFAPP14136 432 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 CKMT2P17540 419 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 TSPAN8P19075 237 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 HIST1H2ADP20671 130 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 NDUFS1P28331 727 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 CSF2RBP32927 897 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 CCR10P46092 362 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 SLC6A12P48065 614 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 ACADVLP49748 655 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 RAB28P51157 221 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 LIMK1P53667 647 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 GFERP55789 205 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 NAE1Q13564 534 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 PCLAFQ15004 111 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 CYP2A13Q16696 494 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 PTCHD3Q3KNS1 767 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 TTC23LQ6PF05 361 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 ATG14Q6ZNE5 492 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 SPRED1Q7Z699 444 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 SLCO6A1Q86UG4 719 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 TRIM73Q86UV7 250 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 C10orf107Q8IVU9 208 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 SYTL1Q8IYJ3 562 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 FBXO39Q8N4B4 442 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 CCDC63Q8NA47 563 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 PDPRQ8NCN5 879 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 OR2L8Q8NGY9 312 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 NCSTNQ92542 709 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 FBXL8Q96CD0 374 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 MED8Q96G25 268 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 CCDC138Q96M89 665 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 TSNARE1Q96NA8 513 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 OR4K3Q96R72 315 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 HIST1H2AJQ99878 128 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 SELENOSQ9BQE4 189 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 NUDT22Q9BRQ3 303 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 H2AFJQ9BTM1 129 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 ACAT2Q9BWD1 397 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 TWSG1Q9GZX9 223 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 KLHL25Q9H0H3 589 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 ABCG4Q9H172 646 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 SRMSQ9H3Y6 488 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 UCK1Q9HA47 277 aa6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RPL23AP28-201ENST00000448062 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.9 ms