RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447402.7

SELENBP1-208, Transcript of selenium binding protein 1, human

TSL 2 BASIC

Gene SELENBP1, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SELENBP1-208	ENST00000447402	PIPSL	A2A3N6	862 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR5K3	A6NET4	321 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	ISM1	B1AKI9	464 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	BTN3A3	O00478	584 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	CDK4	P11802	303 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	PKLR	P30613	574 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	CAPZB	P47756	277 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	KCNC1	P48547	511 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	PNLIPRP1	P54315	467 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	AP1S2	P56377	157 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	13.27	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	TGFBI	Q15582	683 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	ANKS6	Q68DC2	871 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	WDR48	Q8TAF3	677 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	RP1	P56715	2156 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF839	A8K0R7	811 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402		A8MU76	341 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	AGRP	O00253	132 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	COPE	O14579	308 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	SUPT3H	O75486	399 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	RASSF9	O75901	435 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	ANXA5	P08758	320 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	RBP1	P09455	135 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	HSD17B2	P37059	387 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	ID4	P47928	161 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCT5	P48643	541 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	CLDN6	P56747	220 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	CFHR1	Q03591	330 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	C16orf46	Q6P387	395 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	CLEC14A	Q86T13	490 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRABD2A	Q86V40	505 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF480	Q8WV37	535 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	MED8	Q96G25	268 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	GPR78	Q96P69	363 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	SMC6	Q96SB8	1091 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	MENT	Q9BUN1	341 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	STOX2	Q9P2F5	926 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	SYCE1L	A8MT33	242 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	C2orf74	A8MZ97	194 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	UBXN8	O00124	270 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	KERA	O60938	352 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	IMPA1	P29218	277 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	CSF2RB	P32927	897 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	GFER	P55789	205 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	PPP1CA	P62136	330 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	NAE1	Q13564	534 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	CYP2A13	Q16696	494 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	PHF19	Q5T6S3	580 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	AGTRAP	Q6RW13	159 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	ATL1	Q8WXF7	558 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	ACAT2	Q9BWD1	397 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMEM216	Q9P0N5	145 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	XPR1	Q9UBH6	696 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	CEP250	Q9BV73	2442 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402		D6RAR5	112 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402		E7ENX8	843 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	MATN2	O00339	956 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	GLRA3	O75311	464 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	SPAG7	O75391	227 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	GSTA1	P08263	222 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	GFAP	P14136	432 aa		13.24	□□□□□ -0.29

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