RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 KRT222Q8N1A0 295 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 DNAJC22Q8N4W6 341 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 PROKR1Q8TCW9 393 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 PNPLA2Q96AD5 504 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 C19orf60Q96EN9 201 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 IL17FQ96PD4 163 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 RANBP9Q96S59 729 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 NDC1Q9BTX1 674 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 AP1M1Q9BXS5 423 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 CASS4Q9NQ75 786 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 P4HTMQ9NXG6 502 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 EURLQ9NYK6 297 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 NDOR1Q9UHB4 597 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 RIMKLBQ9ULI2 386 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 SRPK3Q9UPE1 567 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 PLCL2Q9UPR0 1127 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 TCAF1Q9Y4C2 921 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 FER1L5A0AVI2 2057 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 TCP11X1B4DZS4 312 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 KRT86O43790 486 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 KDM1AO60341 852 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 SEMA7AO75326 666 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 APOA4P06727 396 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 APRTP07741 180 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 UMODP07911 640 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 RNF224P0DH78 156 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 MAGP20916 626 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 CD9P21926 228 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 GRIA3P42263 894 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 PRAMEP78395 509 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 ACVR1Q04771 509 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 GRB7Q14451 532 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 SSPNQ14714 243 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 DCAF10Q5QP82 559 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 SEL1L2Q5TEA6 688 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 TLDC1Q6P9B6 456 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 NLRP9Q7RTR0 991 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 GALNT16Q8N428 558 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 CCDC89Q8N998 374 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 LINC01555Q8NAE3 123 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 SPC24Q8NBT2 197 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 OR2Y1Q8NGV0 311 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 ASZ1Q8WWH4 475 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 PTERQ96BW5 349 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 IP6K3Q96PC2 410 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 CARD6Q9BX69 1037 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 TSSK1BQ9BXA7 367 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 CHRAC1Q9NRG0 131 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC22A11Q9NSA0 550 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 CATSPERZQ9NTU4 200 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 POLEQ07864 2286 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 CREBBPQ92793 2442 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 ITPR2Q14571 2701 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 GPC4O75487 556 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 RPN2P04844 631 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 ALPPP05187 535 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 CD63P08962 238 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 ITGAXP20702 1163 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 MCM3P25205 808 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 AOAHP28039 575 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 CRADDP78560 199 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 MYBPC3Q14896 1274 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 TMED2Q15363 201 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 SF1Q15637 639 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 CYP2A13Q16696 494 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 FIGLAQ6QHK4 219 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 UNC5DQ6UXZ4 953 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 TTLL10Q6ZVT0 673 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 GAS2L3Q86XJ1 694 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 CLEC1AQ8NC01 280 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 MENTQ9BUN1 341 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC29A3Q9BZD2 475 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 C5AR2Q9P296 337 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 GUCA1BQ9UMX6 200 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP4-206ENST00000446904 KRT87PA6NCN2 255 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 RASGRF2O14827 1237 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 SLCO2B1O94956 709 aa9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.2 ms