RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 OSTF1Q92882 214 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 TOP1MTQ969P6 601 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ZFP3Q96NJ6 502 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 GAL3ST4Q96RP7 486 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 WDR18Q9BV38 432 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 TRIM36Q9NQ86 728 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 K7EPI3 171 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 DCDC1P59894 354 aa6.55□□□□□ -1.36
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USP46-201ENST00000441222 CRHR2Q13324 411 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 LHFPL3Q86UP9 236 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 PM20D2Q8IYS1 436 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 PARP8Q8N3A8 854 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 CAMKVQ8NCB2 501 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 KCNN1Q92952 543 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 RHBDF1Q96CC6 855 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 HEPHQ9BQS7 1158 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 WASF2Q9Y6W5 498 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 CPN2P22792 545 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 F8A1P23610 371 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 SMARCD3Q6STE5 483 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 CBR4Q8N4T8 237 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ACBD6Q9BR61 282 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 NDC1Q9BTX1 674 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 HIPK3Q9H422 1215 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 C11orf16Q9NQ32 467 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 TAS2R14Q9NYV8 317 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 EMC3Q9P0I2 261 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 FBXW2Q9UKT8 454 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 A0A1W2PRQ8 180 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 CAPN8A6NHC0 703 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 M0R036 132 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 SASH3O75995 380 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 PGLSO95336 258 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 EOMESO95936 686 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 IFNA2P01563 188 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 CBSLP0DN79 551 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 CD52P31358 61 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 CBSP35520 551 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 UGT2B10P36537 528 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 GDI2P50395 445 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 HERV-K104P61576 105 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 RPS14P62263 151 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
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USP46-201ENST00000441222 SEC23BQ15437 767 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 GPR33Q49SQ1 333 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 PLPP4Q5VZY2 271 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 TATDN1Q6P1N9 297 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 GPR142Q7Z601 462 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 CMC1Q7Z7K0 106 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 OR10A6Q8NH74 314 aa6.55□□□□□ -1.36
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USP46-201ENST00000441222 TDP1Q9NUW8 608 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 TAS2R1Q9NYW7 299 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 FLRT1Q9NZU1 646 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 CNTN6Q9UQ52 1028 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 PEX12O00623 359 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 HRGP04196 525 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ITGA5P08648 1049 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 S100PP25815 95 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 GLP1RP43220 463 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 DEFA5Q01523 94 aa6.55□□□□□ -1.36
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USP46-201ENST00000441222 PON3Q15166 354 aa6.55□□□□□ -1.36
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USP46-201ENST00000441222 OR52J3Q8NH60 311 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 SCGB1C1Q8TD33 95 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 MND1Q9BWT6 205 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 RIMKLBQ9ULI2 386 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 TRIM64BA6NI03 449 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa6.55□□□□□ -1.36
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USP46-201ENST00000441222 LYPLA2O95372 231 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 NPPAP01160 153 aa6.55□□□□□ -1.36
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USP46-201ENST00000441222 TACR2P21452 398 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 SLC6A9P48067 706 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 NRIP1P48552 1158 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ERVK-8P63133 956 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 GAD2Q05329 585 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 CHAF1BQ13112 559 aa6.55□□□□□ -1.36
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