RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa20.19■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 KLHL41O60662 606 aa20.19■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 ETS1P14921 441 aa20.19■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 MAGP20916 626 aa20.19■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 VARSP26640 1264 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 TMED2Q15363 201 aa20.19■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa20.19■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 MLIPQ5VWP3 458 aa20.19■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 PRUNE1Q86TP1 453 aa20.19■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 LRRC6Q86X45 466 aa20.19■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 Q8NA96 180 aa20.19■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 SPC24Q8NBT2 197 aa20.19■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 OR2L8Q8NGY9 312 aa20.19■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 DLG3Q92796 817 aa20.19■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 PNPLA2Q96AD5 504 aa20.19■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa20.19■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 PANX3Q96QZ0 392 aa20.19■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 NDC1Q9BTX1 674 aa20.19■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 IL22Q9GZX6 179 aa20.19■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 P2RY12Q9H244 342 aa20.19■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 CHRAC1Q9NRG0 131 aa20.19■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 EURLQ9NYK6 297 aa20.19■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 SEC16AO15027 2179 aa20.18■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 NUP210LQ5VU65 1888 aa20.18■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 RASGRF2O14827 1237 aa20.18■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 KPNA5O15131 536 aa20.18■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 ONECUT2O95948 504 aa20.18■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 CTSBP07858 339 aa20.18■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.824e-8■■■■□ 22.1
LIMS1-208ENST00000428064 OTX2P32243 289 aa20.18■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 RPL22P35268 128 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 ARSFP54793 590 aa20.18■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 SNX1Q13596 522 aa20.18■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 RPS6KA1Q15418 735 aa20.18■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa20.18■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 C1orf189Q5VU69 101 aa20.18■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 SLC6A19Q695T7 634 aa20.18■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 FKBP10Q96AY3 582 aa20.18■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 GNPTGQ9UJJ9 305 aa20.18■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 MRFAP1Q9Y605 127 aa20.18■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 IQCF5A8MTL0 148 aa20.17■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 UQCRFS1P47985 274 aa20.17■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 SOX8P57073 446 aa20.17■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 DCAF10Q5QP82 559 aa20.17■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF662Q6ZS27 426 aa20.17■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 CLEC1AQ8NC01 280 aa20.17■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 PTERQ96BW5 349 aa20.17■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 NAV2Q8IVL1 2488 aa20.16■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1B0GX78 115 aa20.16■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 A6NL46 340 aa20.16■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 PEX12O00623 359 aa20.16■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa20.16■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 GNLYP22749 145 aa20.16■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 NPY2RP49146 381 aa20.16■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 MYBPC3Q14896 1274 aa20.16■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 IGFL3Q6UXB1 125 aa20.16■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 KRT222Q8N1A0 295 aa20.16■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 HMGCLL1Q8TB92 370 aa20.16■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 MAIP1Q8WWC4 291 aa20.16■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 RAD51AP1Q96B01 352 aa20.16■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF285Q96NJ3 590 aa20.16■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 SLAMF7Q9NQ25 335 aa20.16■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 IRAK4Q9NWZ3 460 aa20.16■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 KLK4Q9Y5K2 254 aa20.16■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 SHANK1Q9Y566 2161 aa20.16■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa20.16■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 TARM1B6A8C7 271 aa20.15■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 IPO13O94829 963 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 ALBP02768 609 aa20.15■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 ALPPP05187 535 aa20.15■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 UMODP07911 640 aa20.15■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 CDK16Q00536 496 aa20.15■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 TCTE1Q5JU00 501 aa20.15■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 ARMC3Q5W041 872 aa20.15■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 TTC23LQ6PF05 361 aa20.15■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa20.15■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 GALNT16Q8N428 558 aa20.15■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 CFAP61Q8NHU2 1237 aa20.15■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 ZUFSPQ96AP4 578 aa20.15■□□□□ 0.82
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