RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 DNAJB8Q8NHS0 232 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC110Q8TBZ0 833 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 FICDQ9BVA6 458 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 PACSIN1Q9BY11 444 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 MCCC2Q9HCC0 563 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 OR6C2Q9NZP2 312 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 TINAGQ9UJW2 476 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 NENFQ9UMX5 172 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 MAU2Q9Y6X3 613 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 CCL22O00626 93 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 MAP2K7O14733 419 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 SLC19A2O60779 497 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 USP1O94782 785 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 KRT1P04264 644 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 PRR35P0CG20 571 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 PRSS56P0CW18 603 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 ACPPP15309 386 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 ACADLP28330 430 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 PMP22Q01453 160 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 KLC1Q07866 573 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 OLIG2Q13516 323 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 FIGNQ5HY92 759 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 ATG9BQ674R7 924 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 SNX20Q7Z614 316 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 PRSS58Q8IYP2 241 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 TBC1D21Q8IYX1 336 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 CLDN19Q8N6F1 224 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 AMER2Q8N7J2 671 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 DENND1AQ8TEH3 1009 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 HEXDCQ8WVB3 486 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 CHTF18Q8WVB6 975 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 FSD1LQ9BXM9 530 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 LMBRD1Q9NUN5 540 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 CHMP5Q9NZZ3 219 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 A0A1B0GTH6 734 aa18.43■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 C5orf60A6NFR6 353 aa18.43■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 NADKO95544 446 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 CELA2AP08217 269 aa18.43■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 H2AFZP0C0S5 128 aa18.43■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 ITGALP20701 1170 aa18.43■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 GRIA3P42263 894 aa18.43■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 CARSP49589 748 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 CASP6P55212 293 aa18.43■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 KIR2DS3Q14952 304 aa18.43■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 BRD3Q15059 726 aa18.43■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 FAAH2Q6GMR7 532 aa18.43■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 MFSD7Q6UXD7 560 aa18.43■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 H2AFVQ71UI9 128 aa18.43■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa18.43■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 SPOCK3Q9BQ16 436 aa18.43■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 APOL2Q9BQE5 337 aa18.43■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 GORASP1Q9BQQ3 440 aa18.43■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 VPS37BQ9H9H4 285 aa18.43■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 POLG2Q9UHN1 485 aa18.43■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 CACNA1CQ13936 2221 aa18.42■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa18.42■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa18.42■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 MED26O95402 600 aa18.42■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 WDPCPO95876 746 aa18.42■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 CD1EP15812 388 aa18.42■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 NSG1P42857 185 aa18.42■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 NR2C2P49116 596 aa18.42■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 NAPRTQ6XQN6 538 aa18.42■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 SERPINA9Q86WD7 417 aa18.42■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 MMP21Q8N119 569 aa18.42■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 STT3BQ8TCJ2 826 aa18.42■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 ENKD1Q9H0I2 346 aa18.42■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 RSPH14Q9UHP6 348 aa18.42■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 C3orf18Q9UK00 162 aa18.42■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 NAV3Q8IVL0 2385 aa18.41■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 ZGLP1P0C6A0 271 aa18.41■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 COX6A1P12074 109 aa18.41■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 MC4RP32245 332 aa18.41■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 ARHGAP25P42331 645 aa18.41■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 GRM7Q14831 915 aa18.41■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 NR1I3Q14994 352 aa18.41■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 RANBP10Q6VN20 620 aa18.41■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa18.41■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 NDUFAF7Q7L592 441 aa18.41■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP18.41■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 OR5K2Q8NHB8 316 aa18.41■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 MIEF2Q96C03 454 aa18.41■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa18.41■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 LCMT1Q9UIC8 334 aa18.41■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa18.4■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 CST8O60676 142 aa18.4■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 BMP10O95393 424 aa18.4■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 AP2A1O95782 977 aa18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms