RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394299.6

GPC3-202, Transcript of glypican 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GPC3, Length 2,379 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3-202ENST00000394299 SFXN1Q9H9B4 322 aa14.67□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 SLC6A13Q9NSD5 602 aa14.67□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 DNAJC11Q9NVH1 559 aa14.67□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 ATG2BQ96BY7 2078 aa14.67□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 E7EQ34 232 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 KPNA5O15131 536 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 ATG13O75143 517 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 SLC16A8O95907 504 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 EPHX1P07099 455 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 PRLHRP49683 370 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 FOXM1Q08050 763 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 PLA2G15Q8NCC3 412 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 ZUFSPQ96AP4 578 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 PKP4Q99569 1192 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 ACTR3BQ9P1U1 418 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 STAMBPO95630 424 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 CAPNS1P04632 268 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 POU2F2P09086 479 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 NFKBIAP25963 317 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 ITGB7P26010 798 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 GJA4P35212 333 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 GPR1P46091 355 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 HNMTP50135 292 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 VASPP50552 380 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 PDK3Q15120 406 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 CDKL4Q5MAI5 379 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 TBCELQ5QJ74 424 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 OR52E8Q6IFG1 317 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 AGTRAPQ6RW13 159 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 RASGRP3Q8IV61 690 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 HCAR2Q8TDS4 363 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 GTF2H4Q92759 462 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 CGREF1Q99674 301 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 NRTNQ99748 197 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 KXD1Q9BQD3 176 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 SCOCQ9UIL1 159 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 AP4B1Q9Y6B7 739 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 LRRK1Q38SD2 2015 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 DHRS12A0PJE2 317 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 NPC1O15118 1278 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 SLC16A5O15375 505 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 C1QCP02747 245 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 GSTM1P09488 218 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 HRH2P25021 359 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 GSTM4Q03013 218 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 CYP51A1Q16850 503 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 RNF220Q5VTB9 566 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 CACHD1Q5VU97 1274 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 LCN8Q6JVE9 175 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 CRTC3Q6UUV7 619 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 XKR5Q6UX68 686 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 ANKRD46Q86W74 232 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 DPP10Q8N608 796 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 L3MBTL4Q8NA19 623 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 TMIEQ8NEW7 156 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 SLC13A3Q8WWT9 602 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 MIEF2Q96C03 454 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 FBXL8Q96CD0 374 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 NUS1Q96E22 293 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 APOLD1Q96LR9 279 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 EBPLQ9BY08 206 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 SLC29A3Q9BZD2 475 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 PRSS16Q9NQE7 514 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 ATXN10Q9UBB4 475 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
GPC3-202ENST00000394299 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa14.65□□□□□ -0.07
GPC3-202ENST00000394299 SAC3D1A6NKF1 404 aa14.65□□□□□ -0.07
GPC3-202ENST00000394299 ARNTLO00327 626 aa14.65□□□□□ -0.07
GPC3-202ENST00000394299 LILRB5O75023 590 aa14.65□□□□□ -0.07
GPC3-202ENST00000394299 GSNP06396 782 aa14.65□□□□□ -0.07
GPC3-202ENST00000394299 PGRP06401 933 aa14.65□□□□□ -0.07
GPC3-202ENST00000394299 SOX9P48436 509 aa14.65□□□□□ -0.07
GPC3-202ENST00000394299 AP1S2P56377 157 aa14.65□□□□□ -0.07
GPC3-202ENST00000394299 IRF8Q02556 426 aa14.65□□□□□ -0.07
GPC3-202ENST00000394299 CNTN1Q12860 1018 aa14.65□□□□□ -0.07
GPC3-202ENST00000394299 SP140Q13342 867 aa14.65□□□□□ -0.07
GPC3-202ENST00000394299 XKR6Q5GH73 641 aa14.65□□□□□ -0.07
GPC3-202ENST00000394299 CYP2U1Q7Z449 544 aa14.65□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms