RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369306.7

PEX11B-201, Transcript of peroxisomal biogenesis factor 11 beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PEX11B, Length 1,740 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11B-201ENST00000369306 LIPJQ5W064 366 aa14.94□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 OR2L2Q8NH16 312 aa14.94□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 PKP4Q99569 1192 aa14.94□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 PCDHAC1Q9H158 963 aa14.94□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa14.94□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 CKAP5Q14008 2032 aa14.93□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 ANHXE9PGG2 379 aa14.93□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 SEC22BO75396 215 aa14.93□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 SLC16A8O95907 504 aa14.93□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 C8BP07358 591 aa14.93□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 RPSAP08865 295 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 HSD17B1P14061 328 aa14.93□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 VARSP26640 1264 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 IMPA1P29218 277 aa14.93□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 CHIT1Q13231 466 aa14.93□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 HTR4Q13639 388 aa14.93□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 NFYCQ13952 458 aa14.93□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 C6orf10Q5SRN2 563 aa14.93□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 CACHD1Q5VU97 1274 aa14.93□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 FRG2Q64ET8 278 aa14.93□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 C11orf96Q7Z7L8 435 aa14.93□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 KBTBD2Q8IY47 623 aa14.93□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 SELENOMQ8WWX9 145 aa14.93□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 FRG2BQ96QU4 278 aa14.93□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 DPEP2Q9H4A9 486 aa14.93□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 CMTM6Q9NX76 183 aa14.93□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 LMCD1Q9NZU5 365 aa14.93□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 UNC80Q8N2C7 3258 aa14.93□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 MGAT4DA6NG13 374 aa14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 LTBRP36941 435 aa14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 HALP42357 657 aa14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 IRF8Q02556 426 aa14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 NAE1Q13564 534 aa14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 WSCD2Q2TBF2 565 aa14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 MAP7D1Q3KQU3 841 aa14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 SLC44A4Q53GD3 710 aa14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 PRR23BQ6ZRT6 265 aa14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 HEATR4Q86WZ0 1026 aa14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 PQLC1Q8N2U9 271 aa14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 HDDC3Q8N4P3 179 aa14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 HM13Q8TCT9 377 aa14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 TMEM125Q96AQ2 219 aa14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 MSLNLQ96KJ4 702 aa14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 OR4K3Q96R72 315 aa14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 CLDND1Q9NY35 253 aa14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 SERGEFQ9UGK8 458 aa14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 PCDH8O95206 1070 aa14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 PCSK2P16519 638 aa14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 ACADLP28330 430 aa14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 TEAD1P28347 426 aa14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 TIE1P35590 1138 aa14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 NEK2P51955 445 aa14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 SEC13P55735 322 aa14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 RPS14P62263 151 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 YBX1P67809 324 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 CDK3Q00526 305 aa14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 RHDQ02161 417 aa14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 PTGR1Q14914 329 aa14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 CRTC3Q6UUV7 619 aa14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 SPATA24Q86W54 205 aa14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 CACUL1Q86Y37 369 aa14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 TMEM126BQ8IUX1 230 aa14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 TDHQ8IZJ6 230 aa14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 LIX1Q8N485 282 aa14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 OR2T3Q8NH03 318 aa14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 CMTM7Q96FZ5 175 aa14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 ZBTB18Q99592 522 aa14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 GABRG3Q99928 467 aa14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa14.92□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 A0A1W2PP55 124 aa14.91□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa14.91□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 BCKDHAP12694 445 aa14.91□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 ACPPP15309 386 aa14.91□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 CD22P20273 847 aa14.91□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 BMP8BP34820 402 aa14.91□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 CASP2P42575 452 aa14.91□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 BNIP2Q12982 314 aa14.91□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 RPA4Q13156 261 aa14.91□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 DOC2AQ14183 400 aa14.91□□□□□ -0.02
PEX11B-201ENST00000369306 E2F2Q14209 437 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms