RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 PAGE2Q7Z2X7 111 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TEX9Q8N6V9 391 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 PLA2G15Q8NCC3 412 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ACVR1CQ8NER5 493 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 STARD8Q92502 1023 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ERP44Q9BS26 406 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CAPS2Q9BXY5 557 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ALG9Q9H6U8 611 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 PLCL2Q9UPR0 1127 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 VWA7Q9Y334 891 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ROS1P08922 2347 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TFECO14948 347 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 LIASO43766 372 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 KCNJ13O60928 360 aa4.32□□□□□ -1.72
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PTPRC-201ENST00000348564 CLEC3AO75596 197 aa4.32□□□□□ -1.72
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PTPRC-201ENST00000348564 HSD17B2P37059 387 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CTSKP43235 329 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 NCALDP61601 193 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 HSD11B2P80365 405 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ZBTB17Q13105 803 aa4.32□□□□□ -1.72
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PTPRC-201ENST00000348564 LY6DQ14210 128 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TAF11Q15544 211 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ISXQ2M1V0 245 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 GALNTL6Q49A17 601 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 FBXO48Q5FWF7 155 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TTC27Q6P3X3 843 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 Q6ZNB5 142 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 RFLNAQ6ZTI6 216 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TRIM69Q86WT6 500 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 SCML4Q8N228 414 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 STAG3L4Q8TBR4 150 aa4.32□□□□□ -1.72
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PTPRC-201ENST00000348564 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 LRRC19Q9H756 370 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 NMRAL1Q9HBL8 299 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 STARD5Q9NSY2 213 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 SYBUQ9NX95 663 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ACTR10Q9NZ32 417 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 EFR3BQ9Y2G0 817 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC168Q8NDH2 2452 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TRIM49D1C9J1S8 452 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TOR1BO14657 336 aa4.32□□□□□ -1.72
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PTPRC-201ENST00000348564 OLFM2O95897 454 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 C9P02748 559 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 C1QTNF9P0C862 333 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CD46P15529 392 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 IL1RNP18510 177 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 PGAM1P18669 254 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CAPZA2P47755 286 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 SERPINB9P50453 376 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 COL28A1Q2UY09 1125 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TBC1D25Q3MII6 688 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 AGBL4Q5VU57 503 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 SPATA6LQ8N4H0 392 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ADCY4Q8NFM4 1077 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 LRRC61Q9BV99 259 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 PARD6AQ9NPB6 346 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 POT1Q9NUX5 634 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 EDARQ9UNE0 448 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CEP295Q9C0D2 2601 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TRPM6Q9BX84 2022 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC189A1A4V9 331 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 RGSL1A5PLK6 1076 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 SGTAO43765 313 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 MAFKO60675 156 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 MYL2P10916 166 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CCL4P13236 92 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 NTSP30990 170 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 GP5P40197 560 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CENPAP49450 140 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CCR8P51685 355 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 NRG3P56975 720 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 BTN3A2P78410 334 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 NIPAL4Q0D2K0 466 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 NR6A1Q15406 480 aa4.31□□□□□ -1.72
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