RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 OGFOD2Q6N063 350 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 PLET1Q6UQ28 207 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 SVOPLQ8N434 492 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC54Q8NEL0 328 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF358Q9NW07 568 aa21.93■■□□□ 1.1
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PTPRM-201ENST00000332175 BRD7Q9NPI1 651 aa21.92■■□□□ 1.1
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PTPRM-201ENST00000332175 KCNQ1P51787 676 aa21.91■■□□□ 1.1
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PTPRM-201ENST00000332175 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa21.9■■□□□ 1.1
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PTPRM-201ENST00000332175 ERVK-6Q9BXR3 956 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 DAPL1A0PJW8 107 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 HAS3O00219 553 aa21.9■■□□□ 1.1
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