RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
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ACTB-201ENST00000331789 NMRK1Q9NWW6 199 aa17.39■□□□□ 0.37
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ACTB-201ENST00000331789 XKR6Q5GH73 641 aa17.38■□□□□ 0.37
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ACTB-201ENST00000331789 RNF175Q8N4F7 328 aa17.38■□□□□ 0.37
ACTB-201ENST00000331789 OR56A3Q8NH54 315 aa17.38■□□□□ 0.37
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ACTB-201ENST00000331789 C1orf109Q9NX04 203 aa17.38■□□□□ 0.37
ACTB-201ENST00000331789 FBXL12Q9NXK8 326 aa17.38■□□□□ 0.37
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ACTB-201ENST00000331789 SLC2A7Q6PXP3 512 aa17.37■□□□□ 0.37
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ACTB-201ENST00000331789 IL17RCQ8NAC3 791 aa17.37■□□□□ 0.37
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ACTB-201ENST00000331789 ACADLP28330 430 aa17.37■□□□□ 0.37
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ACTB-201ENST00000331789 SDE2Q6IQ49 451 aa17.37■□□□□ 0.37
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ACTB-201ENST00000331789 DHDDSQ86SQ9 333 aa17.37■□□□□ 0.37
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ACTB-201ENST00000331789 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa17.37■□□□□ 0.37
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ACTB-201ENST00000331789 BCAP29Q9UHQ4 241 aa17.37■□□□□ 0.37
ACTB-201ENST00000331789 JAK1P23458 1154 aa17.36■□□□□ 0.37
ACTB-201ENST00000331789 ADGRE1Q14246 886 aa17.36■□□□□ 0.37
ACTB-201ENST00000331789 STARD3Q14849 445 aa17.36■□□□□ 0.37
ACTB-201ENST00000331789 MUM1Q2TAK8 710 aa17.36■□□□□ 0.37
ACTB-201ENST00000331789 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
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