RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328839.3

PPP4R4-202, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP4R4, Length 876 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4-202ENST00000328839 EURLQ9NYK6 297 aa24.1■■□□□ 1.45
PPP4R4-202ENST00000328839 DDAH2O95865 285 aa24.09■■□□□ 1.45
PPP4R4-202ENST00000328839 UMODP07911 640 aa24.09■■□□□ 1.45
PPP4R4-202ENST00000328839 RAB28P51157 221 aa24.09■■□□□ 1.45
PPP4R4-202ENST00000328839 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
PPP4R4-202ENST00000328839 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
PPP4R4-202ENST00000328839 TTLL10Q6ZVT0 673 aa24.09■■□□□ 1.45
PPP4R4-202ENST00000328839 TMEM151BQ8IW70 566 aa24.09■■□□□ 1.45
PPP4R4-202ENST00000328839 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa24.09■■□□□ 1.45
PPP4R4-202ENST00000328839 TM9SF4Q92544 642 aa24.09■■□□□ 1.45
PPP4R4-202ENST00000328839 DLG3Q92796 817 aa24.09■■□□□ 1.45
PPP4R4-202ENST00000328839 TSSK1BQ9BXA7 367 aa24.09■■□□□ 1.45
PPP4R4-202ENST00000328839 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
PPP4R4-202ENST00000328839 TEX15Q9BXT5 2789 aa24.08■■□□□ 1.45
PPP4R4-202ENST00000328839 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
PPP4R4-202ENST00000328839 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
PPP4R4-202ENST00000328839 E7EVH7 732 aa24.08■■□□□ 1.45
PPP4R4-202ENST00000328839 IPO13O94829 963 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
PPP4R4-202ENST00000328839 IFNB1P01574 187 aa24.08■■□□□ 1.45
PPP4R4-202ENST00000328839 RPN2P04844 631 aa24.08■■□□□ 1.45
PPP4R4-202ENST00000328839 CCR7P32248 378 aa24.08■■□□□ 1.45
PPP4R4-202ENST00000328839 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
PPP4R4-202ENST00000328839 TSTD2Q5T7W7 516 aa24.08■■□□□ 1.45
PPP4R4-202ENST00000328839 VRK3Q8IV63 474 aa24.08■■□□□ 1.45
PPP4R4-202ENST00000328839 SLC22A15Q8IZD6 547 aa24.08■■□□□ 1.45
PPP4R4-202ENST00000328839 ZADH2Q8N4Q0 377 aa24.08■■□□□ 1.45
PPP4R4-202ENST00000328839 OR4L1Q8NH43 312 aa24.08■■□□□ 1.45
PPP4R4-202ENST00000328839 ETNK1Q9HBU6 452 aa24.08■■□□□ 1.45
PPP4R4-202ENST00000328839 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa24.08■■□□□ 1.45
PPP4R4-202ENST00000328839 ITGA3P26006 1051 aa24.07■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 PRAMEP78395 509 aa24.07■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 LINC01555Q8NAE3 123 aa24.07■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa24.07■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa24.07■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF778Q96MU6 729 aa24.07■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 IL17FQ96PD4 163 aa24.07■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 CDC23Q9UJX2 597 aa24.07■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 DOCK10Q96BY6 2186 aa24.07■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 A0A1B0GX78 115 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 IQCF5A8MTL0 148 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 AGPSO00116 658 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 ALOX12BO75342 701 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 APOA4P06727 396 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 CD9P21926 228 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 GRIA1P42261 906 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 GLRBP48167 497 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 ARSFP54793 590 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 KIF5AQ12840 1032 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 IGFL3Q6UXB1 125 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 ASZ1Q8WWH4 475 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 SLC22A18Q96BI1 424 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 SLC22A11Q9NSA0 550 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 ANAPC5Q9UJX4 755 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 FBXL4Q9UKA2 621 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 CBX6O95503 412 aa24.05■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 ADRA1DP25100 572 aa24.05■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 FDFT1P37268 417 aa24.05■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 GRIA3P42263 894 aa24.05■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 SEMA3AQ14563 771 aa24.05■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF534Q76KX8 674 aa24.05■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 KRT222Q8N1A0 295 aa24.05■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 DENND1AQ8TEH3 1009 aa24.05■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 INPP5DQ92835 1189 aa24.05■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 RANBP9Q96S59 729 aa24.05■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 SLC39A10Q9ULF5 831 aa24.05■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 A0A0U1RQJ8 604 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 ANKUB1A6NFN9 424 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 S1PR4O95977 384 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 STIP1P31948 543 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 TMED2Q15363 201 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 SF1Q15637 639 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 UNC5DQ6UXZ4 953 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 TXLNBQ8N3L3 684 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 GSDMBQ8TAX9 411 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 FKBP10Q96AY3 582 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 DESI2Q9BSY9 194 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 CARD6Q9BX69 1037 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 SLC6A20Q9NP91 592 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 CUTCQ9NTM9 273 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 RIMKLBQ9ULI2 386 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF148Q9UQR1 794 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 TCAF1Q9Y4C2 921 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 LIASO43766 372 aa24.03■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 SUN1O94901 812 aa24.03■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 ITGAXP20702 1163 aa24.03■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 MMP11P24347 488 aa24.03■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 MCM3P25205 808 aa24.03■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms