RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 SBSNQ6UWP8 590 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC91Q7Z6B0 441 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 ISL2Q96A47 359 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 SCNM1Q9BWG6 230 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 STRADBQ9C0K7 418 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 SPHK1Q9NYA1 384 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 ACTR10Q9NZ32 417 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 KLK13Q9UKR3 277 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 ISM1B1AKI9 464 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 CTIFO43310 598 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 CCKBRP32239 447 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 CSRP3P50461 194 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 DLG1Q12959 904 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 FRA10AC1Q70Z53 315 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 MYRIPQ8NFW9 859 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 KCTD4Q8WVF5 259 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 ARL15Q9NXU5 204 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 PDP2Q9P2J9 529 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 POMT2Q9UKY4 750 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 PLAAQ9Y263 795 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 TLDC2A0PJX2 215 aa21.61■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 GUCA1CO95843 209 aa21.61■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 MPOP05164 745 aa21.61■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 SLC26A3P40879 764 aa21.61■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 MAGEA12P43365 314 aa21.61■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 CACHD1Q5VU97 1274 aa21.61■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 TDRPQ86YL5 185 aa21.61■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 SYTL1Q8IYJ3 562 aa21.61■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF480Q8WV37 535 aa21.61■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 NXNL1Q96CM4 212 aa21.61■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC138Q96M89 665 aa21.61■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 MAP3K3Q99759 626 aa21.61■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 NMRAL1Q9HBL8 299 aa21.61■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 IGSF5Q9NSI5 407 aa21.61■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 CDH16O75309 829 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 UGT2B7P16662 529 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 CDH3P22223 829 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 HSD17B2P37059 387 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 PNLIPRP1P54315 467 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 ADAMTS20P59510 1910 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP21.6■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 KIR2DS3Q14952 304 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 ARHGAP19Q14CB8 494 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 CYP2A13Q16696 494 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 PPP1R3AQ16821 1122 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 FAM83EQ2M2I3 478 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 ERMP1Q7Z2K6 904 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 PPFIBP2Q8ND30 876 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 PTERQ96BW5 349 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 PPM1MQ96MI6 270 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 CD180Q99467 661 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 ALG9Q9H6U8 611 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 ABCF3Q9NUQ8 709 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 WASF3Q9UPY6 502 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 AKAP13Q12802 2813 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 TLCD2A6NGC4 264 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF839A8K0R7 811 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 RFPL1O75677 317 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 ERGP11308 486 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 KRT15P19012 456 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 TFEBP19484 476 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 IMPA1P29218 277 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 SEPHS1P49903 392 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 AP1S2P56377 157 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 C16orf72Q14CZ0 275 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 OR4D1Q15615 310 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 SPESP1Q6UW49 350 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 SUSD1Q6UWL2 747 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 TIFABQ6ZNK6 161 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 CNPY4Q8N129 248 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 HMGCLL1Q8TB92 370 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 KIAA1191Q96A73 305 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 SLC22A18Q96BI1 424 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 GRAMD1AQ96CP6 724 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 OR2A14Q96R47 310 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 PCMTD2Q9NV79 361 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 OARD1Q9Y530 152 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 NCOR2Q9Y618 2525 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 KLHL2O95198 593 aa21.58■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP21.58■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 GLRBP48167 497 aa21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms