RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 TBC1D21Q8IYX1 336 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 SLC15A4Q8N697 577 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 MFSD2AQ8NA29 543 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 BPIFB1Q8TDL5 484 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 GIPC3Q8TF64 312 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 ALG14Q96F25 216 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 CORO1BQ9BR76 489 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 BDH2Q9BUT1 245 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP8.46□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 COQ6Q9Y2Z9 468 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 OR51B4Q9Y5P0 310 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa8.46□□□□□ -1.06
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GINS1-201ENST00000262460 CCL16O15467 120 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 FZD6O60353 706 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 RFPL2O75678 378 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 STK16O75716 305 aa8.46□□□□□ -1.06
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GINS1-201ENST00000262460 GPIP06744 558 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 EPB42P16452 691 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 ACRV1P26436 265 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 HLA-FP30511 346 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 ETV3P41162 512 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 GNPDA1P46926 289 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 PTSQ03393 145 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 MESP2Q0VG99 397 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 RAPSNQ13702 412 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 DAG1Q14118 895 aa8.46□□□□□ -1.06
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GINS1-201ENST00000262460 TMEM236Q5W0B7 351 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 KLHL17Q6TDP4 642 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 Q6ZVL8 140 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 MMP21Q8N119 569 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 ASB2Q96Q27 587 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 HIPK3Q9H422 1215 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 PKD2L2Q9NZM6 624 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 KLHL33A6NCF5 533 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 ANKRD33BA6NCL7 494 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 TEX28O15482 410 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 GREM1O60565 184 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 GMNNO75496 209 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 BMP10O95393 424 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 ETHE1O95571 254 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 PENKP01210 267 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 POU2F1P14859 743 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 ITGALP20701 1170 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 OR1E2P47887 323 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 BMXP51813 675 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 PLA2G16P53816 162 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 NTHL1P78549 312 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 MVKQ03426 396 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 ITGADQ13349 1161 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 MADCAM1Q13477 382 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 GPRC6AQ5T6X5 926 aa8.45□□□□□ -1.06
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GINS1-201ENST00000262460 SLC8B1Q6J4K2 584 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 CYP4Z1Q86W10 505 aa8.45□□□□□ -1.06
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GINS1-201ENST00000262460 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 ELOVL6Q9H5J4 265 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 POPDC3Q9HBV1 291 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 WDR70Q9NW82 654 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 FAM118AQ9NWS6 357 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 NUDT4Q9NZJ9 180 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 SELENONQ9NZV5 590 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 ZIM2Q9NZV7 527 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 ERVK-18Q9QC07 812 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 MTRRQ9UBK8 725 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 SDK1Q7Z5N4 2213 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 PLXNA3P51805 1871 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 ELOVL7A1L3X0 281 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 CREG1O75629 220 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 FKBP9O95302 570 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 CDH1P12830 882 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 CD22P20273 847 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 HTR1EP28566 365 aa8.45□□□□□ -1.06
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GINS1-201ENST00000262460 BDKRB1P46663 353 aa8.45□□□□□ -1.06
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GINS1-201ENST00000262460 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 MAPK11Q15759 364 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 FKBP9P1Q75LS8 142 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 NLGN4XQ8N0W4 816 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 TBC1D15Q8TC07 691 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 CCDC138Q96M89 665 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 FNIP2Q9P278 1114 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 ACSL6Q9UKU0 697 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 SLC6A14Q9UN76 642 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 H7C4K7 107 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 RAP2AP10114 183 aa8.44□□□□□ -1.06
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