RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 MAP2K7O14733 419 aa15.7■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 UGT1A9O60656 530 aa15.7■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 ZWINTO95229 277 aa15.7■□□□□ 0.1
SPCS1-201ENST00000233025 GYPCP04921 128 aa15.7■□□□□ 0.1
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SPCS1-201ENST00000233025 TAS2R40P59535 323 aa15.67■□□□□ 0.1
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SPCS1-201ENST00000233025 NDUFAF7Q7L592 441 aa15.67■□□□□ 0.1
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