RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219439.8

HSDL1-201, Transcript of hydroxysteroid dehydrogenase like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HSDL1, Length 3,519 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSDL1-201ENST00000219439 PHC1P78364 1004 aa14.6□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 SMARCB1Q12824 385 aa14.6□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 CBX3Q13185 183 aa14.6□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 LAIR2Q6ISS4 152 aa14.6□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 TRAF7Q6Q0C0 670 aa14.6□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 DBF4BQ8NFT6 615 aa14.6□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 ACPTQ9BZG2 426 aa14.6□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 ARL15Q9NXU5 204 aa14.6□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa14.6□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 DIRAS1O95057 198 aa14.6□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 FSHRP23945 695 aa14.6□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 ZNF691Q5VV52 312 aa14.6□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 GALNT10Q86SR1 603 aa14.6□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa14.6□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 MCOLN3Q8TDD5 553 aa14.6□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 PIH1D2Q8WWB5 315 aa14.6□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 MUL1Q969V5 352 aa14.6□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 CASD1Q96PB1 797 aa14.6□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 ELOVL6Q9H5J4 265 aa14.6□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 FZD6O60353 706 aa14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 NBNO60934 754 aa14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 CLDN9O95484 217 aa14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 PDYNP01213 254 aa14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 RETP07949 1114 aa14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 DGCR6Q14129 220 aa14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 TRIM16LQ309B1 348 aa14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 PERM1Q5SV97 790 aa14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 BTLAQ7Z6A9 289 aa14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 KLHL23Q8NBE8 558 aa14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 PYURFQ96I23 114 aa14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 RETREG1Q9H6L5 497 aa14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 TRPS1Q9UHF7 1281 aa14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 TBKBP1A7MCY6 615 aa14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 PER2O15055 1255 aa14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 ACRV1P26436 265 aa14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 CDKN2CP42773 168 aa14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 CD97P48960 835 aa14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 TUFMP49411 452 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 GP2P55259 537 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 RELAQ04206 551 aa14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 BCL2L1Q07817 233 aa14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 ATG9BQ674R7 924 aa14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 DOK6Q6PKX4 331 aa14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 TRIM46Q7Z4K8 759 aa14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 SLCO6A1Q86UG4 719 aa14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 HIPK1Q86Z02 1210 aa14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 CDC26Q8NHZ8 85 aa14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 WFDC5Q8TCV5 224 aa14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 FKBP10Q96AY3 582 aa14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 VNN3Q9NY84 501 aa14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 ENPP5Q9UJA9 477 aa14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 ERGIC3Q9Y282 383 aa14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 FAM220BPB1ANY3 271 aa14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 ERN1O75460 977 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 WDR47O94967 919 aa14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 GALTP07902 379 aa14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 ANXA5P08758 320 aa14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 TACR1P25103 407 aa14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 MAP2K4P45985 399 aa14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 BCAP31P51572 246 aa14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 CDK5R2Q13319 367 aa14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 CYP2A13Q16696 494 aa14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 RORBQ92753 470 aa14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 GLMNQ92990 594 aa14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 PYCR2Q96C36 320 aa14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 CWH43Q9H720 699 aa14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 RMND5AQ9H871 391 aa14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 ERVK-18Q9QC07 812 aa14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 DAPK2Q9UIK4 370 aa14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 hCG_2039718K7EN88 272 aa14.58□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 AXIN1O15169 862 aa14.58□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 BPIP17213 487 aa14.58□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 IDUAP35475 653 aa14.58□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 NRIP1P48552 1158 aa14.58□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 RPIAP49247 311 aa14.58□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 TTLL9Q3SXZ7 439 aa14.58□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 KIAA1841Q6NSI8 718 aa14.58□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 OR7A2PQ8NGA2 310 aa14.58□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
HSDL1-201ENST00000219439 CHPT1Q8WUD6 406 aa14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms