RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000037117.5

Gtf3c4-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c4, Length 6,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Ulk1O70405 1051 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Polr2cP97760 275 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Q3UY34 256 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Olfr328Q5NCD3 310 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Serpinf2Q61247 491 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Tnpo3Q6P2B1 923 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Cldn17Q8BXA6 224 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Sfrp1Q8C4U3 314 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Tnfaip8Q921Z5 198 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Kcne2Q9D808 123 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Slc28a3Q9ERH8 703 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 MazP56671 477 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 EregQ61521 162 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Bdh1Q80XN0 343 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Coro2bQ8BH44 480 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Olfr809Q8VEX8 328 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Ric1Q69ZJ7 1422 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Slit3Q9WVB4 1523 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Gm11027G8JL69 66 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Csf1P07141 552 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Ptpn12P35831 775 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Pde12Q3TIU4 608 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 1700057G04RikQ3V0U0 232 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Tmprss11eQ5S248 423 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 ProcrQ64695 242 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Zswim5Q80TC6 1188 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Sp110Q8BVK9 445 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 TdrpQ8C5P7 182 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Gprc6aQ8K4Z6 928 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Sohlh2Q9D489 467 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Gm4302E9PX25 294 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 PorP37040 678 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Lypla1P97823 230 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Ddx4Q61496 702 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Xpnpep1Q6P1B1 623 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Olfr1313Q7TQW8 311 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Ccser1Q8C0C4 895 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Rnaseh2cQ9CQ18 166 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Rpl4Q9D8E6 419 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Btbd18A0A0A6YY25 723 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 4930558K02RikE0CXC6 182 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Gcnt4E9Q649 455 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Gm5798F7BTS7 198 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 AurkbO70126 345 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Il13ra2O88786 383 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 MipP51180 263 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Foxp2P58463 714 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Slc12a3P59158 1002 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Fam214aQ69ZK7 1075 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Proser3Q7TSA6 634 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 CblcQ80XL1 496 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 BoraQ8BS90 525 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Larp4Q8BWW4 719 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 FarsaQ8C0C7 508 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Agfg1Q8K2K6 561 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Treml1Q8K558 317 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Olfr818Q8VG46 318 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Rwdd3Q8VIL2 267 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Mrps2Q924T2 291 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Prl2a1Q9JHK0 228 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Slc9a3r2Q9JHL1 337 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Frmd7A2AD83 703 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 D3Z070 196 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Gm21876F6XK35 94 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 4930544D05RikJ3QK56 214 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Vmn2r52L7N2B2 852 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Phb2O35129 299 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 ChadO55226 358 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 SmsP97355 366 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Psme2P97372 239 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Gm6760Q0ZNK3 87 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Q5XFZ0 217 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 EdnraQ61614 427 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 CtifQ6PEE2 600 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Slc6a7Q6PGE7 637 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 BlmhQ8R016 455 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Olfr695Q8VFM3 315 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Olfr45Q8VGM1 311 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Wasf3Q8VHI6 501 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Gprc5bQ923Z0 410 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Coro1cQ9WUM4 474 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Gm5134E9QAB5 671 aa11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Dsg2O55111 1122 aa11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Pcid2Q8BFV2 399 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Q8C4P0 716 aa11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Olfr801Q8VEU1 318 aa11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Bbc3Q99ML1 193 aa11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Tsga13Q9DA17 273 aa11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Oxct2bQ9ESL0 520 aa11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Oxct2aQ9JJN4 520 aa11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Nfkb2Q9WTK5 899 aa11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Pdpk1Q9Z2A0 559 aa11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Ehbp1l1Q99MS7 1716 aa11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Usp32F8VPZ3 1604 aa11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 DgkdE9PUQ8 1220 aa11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Vmn2r116E9Q6I0 856 aa11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 JhyE9Q793 770 aa11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Vmn2r65G3X931 845 aa11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Chrm1P12657 460 aa11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 LipcP27656 510 aa11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 50.5 ms