RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001226.9

Sh3bp1-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Spata6Q3U6K5 488 aa16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Clca4bQ3UW98 925 aa16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Naa11Q3UX61 218 aa16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr1288Q7TQY0 312 aa16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr1085Q7TR64 313 aa16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rbm4Q8C7Q4 361 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Unc5aQ8K1S4 898 aa16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kcnc4Q8R1C0 628 aa16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ankrd49Q8VE42 238 aa16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rbm4bQ8VE92 357 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pcdhb19Q91Y01 801 aa16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Asb9Q91ZT8 290 aa16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Efhc2Q9D485 750 aa16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nif3l1Q9EQ80 376 aa16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zbtb18Q9WUK6 522 aa16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc25a14Q9Z2B2 325 aa16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nlrc5C3VPR6 1915 aa16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fam181aJ3QNB7 292 aa16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc16a8O35308 492 aa16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pole2O54956 527 aa16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 SmoP56726 793 aa16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Arhgap39P59281 1107 aa16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gabarapl2P60521 117 aa16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Irf7P70434 457 aa16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 MitfQ08874 526 aa16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nt5c3bQ3UFY7 300 aa16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tapt1Q4VBD2 564 aa16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sfmbt2Q5DTW2 938 aa16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Bhlhb9Q6PB60 539 aa16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dsg4Q7TMD7 1041 aa16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Arhgap19Q8BRH3 494 aa16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rcor1Q8CFE3 480 aa16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn1r215Q8R264 300 aa16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr398Q8VFY0 314 aa16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr1263Q8VG63 306 aa16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pcdhb21Q91V48 774 aa16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mlf2Q99KX1 247 aa16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PyurfQ9D1C3 112 aa16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn1r65Q9EPS7 332 aa16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 HgfacQ9R098 653 aa16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Padi3Q9Z184 664 aa16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Armc4B2RY50 1037 aa16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm4450E9Q007 373 aa16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gnpda1O88958 289 aa16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Itm2bO89051 266 aa16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mkl2P59759 1080 aa16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rbm15Q0VBL3 962 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hdgfl2Q3UMU9 669 aa16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr381Q5SSP0 311 aa16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Foxj1Q61660 421 aa16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hsd3b4Q61767 373 aa16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rap2aQ80ZJ1 183 aa16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nlrp10Q8CCN1 673 aa16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Znf668Q8K2R5 619 aa16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn1r33Q8R2E0 305 aa16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 TbccQ8VCN9 341 aa16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr691Q8VGW5 322 aa16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ergic3Q9CQE7 383 aa16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mcm8Q9CWV1 833 aa16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Q9D5Y0 588 aa16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Smim23Q9DAL0 136 aa16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gpr63Q9EQQ3 425 aa16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sgk2Q9QZS5 367 aa16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Adamts5Q9R001 930 aa16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sppl2cA2A6C4 690 aa16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm13040A2A8C4 496 aa16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm13101A2ASJ0 481 aa16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm13119B1ARV5 481 aa16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Otud3B1AZ99 396 aa16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm10800D3Z496 220 aa16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nccrp1G3X9C2 266 aa16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rhox2hK7N6P1 191 aa16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 BgnP28653 369 aa16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ptpn6P29351 595 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 TfamP40630 243 aa16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 A630001G21RikQ3UTB2 229 aa16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cdk15Q3V3A1 433 aa16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pdcd4Q61823 469 aa16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Colgalt2Q6NVG7 625 aa16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 AftphQ80WT5 931 aa16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 SntnQ8C9X1 147 aa16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Elp2Q91WG4 831 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 MlycdQ99J39 492 aa16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lactb2Q99KR3 288 aa16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rgs18Q99PG4 235 aa16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Det1Q9D0A0 550 aa16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 AicdaQ9WVE0 198 aa16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Myo10F8VQB6 2062 aa16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vsig10lD3YZF7 868 aa16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn2r125D3Z3M1 369 aa16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm2237E9Q501 211 aa16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm3591K7N6X2 186 aa16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Scrg1O88745 98 aa16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 P06324 132 aa16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Itgb1P09055 798 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 En2P09066 324 aa16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cbx3P23198 183 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 DsppP97399 934 aa16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hk3Q3TRM8 922 aa16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 HecaQ3V1N5 544 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.7 ms