RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
PMS1-222ENST00000639501 FAM177BA6PVY3 158 aa24.89■■□□□ 1.58
PMS1-222ENST00000639501 LMOD3Q0VAK6 560 aa24.89■■□□□ 1.57
PMS1-222ENST00000639501 NME9Q86XW9 330 aa24.89■■□□□ 1.57
PMS1-222ENST00000639501 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
PMS1-222ENST00000639501 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
PMS1-222ENST00000639501 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
PMS1-222ENST00000639501 PIBF1Q8WXW3 757 aa24.88■■□□□ 1.57
PMS1-222ENST00000639501 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa24.88■■□□□ 1.57
PMS1-222ENST00000639501 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.88■■□□□ 1.57
PMS1-222ENST00000639501 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
PMS1-222ENST00000639501 USP48Q86UV5 1035 aa24.87■■□□□ 1.57
PMS1-222ENST00000639501 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa24.87■■□□□ 1.57
PMS1-222ENST00000639501 OSBPL3Q9H4L5 887 aa24.87■■□□□ 1.57
PMS1-222ENST00000639501 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
PMS1-222ENST00000639501 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
PMS1-222ENST00000639501 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
PMS1-222ENST00000639501 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP24.85■■□□□ 1.57
PMS1-222ENST00000639501 TPRNQ4KMQ1 711 aa24.85■■□□□ 1.57
PMS1-222ENST00000639501 ATP7BP35670 1465 aa24.84■■□□□ 1.57
PMS1-222ENST00000639501 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
PMS1-222ENST00000639501 MCM2P49736 904 aa24.84■■□□□ 1.57
PMS1-222ENST00000639501 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa24.84■■□□□ 1.57
PMS1-222ENST00000639501 AEBP1Q8IUX7 1158 aa24.83■■□□□ 1.57
PMS1-222ENST00000639501 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
PMS1-222ENST00000639501 SALL3Q9BXA9 1300 aa24.83■■□□□ 1.57
PMS1-222ENST00000639501 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.83■■□□□ 1.57
PMS1-222ENST00000639501 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.83■■□□□ 1.57
PMS1-222ENST00000639501 ANO2Q9NQ90 1003 aa24.83■■□□□ 1.57
PMS1-222ENST00000639501 ADCY5O95622 1261 aa24.82■■□□□ 1.56
PMS1-222ENST00000639501 MCM10Q7L590 875 aa24.82■■□□□ 1.56
PMS1-222ENST00000639501 PRIMPOLQ96LW4 560 aa24.82■■□□□ 1.56
PMS1-222ENST00000639501 ALKQ9UM73 1620 aa24.82■■□□□ 1.56
PMS1-222ENST00000639501 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.81■■□□□ 1.56
PMS1-222ENST00000639501 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
PMS1-222ENST00000639501 DMTNQ08495 405 aa24.81■■□□□ 1.56
PMS1-222ENST00000639501 F6X3S4 739 aa24.81■■□□□ 1.56
PMS1-222ENST00000639501 PHF14O94880 888 aa24.81■■□□□ 1.56
PMS1-222ENST00000639501 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP24.81■■□□□ 1.56
PMS1-222ENST00000639501 IL25Q9H293 177 aa24.81■■□□□ 1.56
PMS1-222ENST00000639501 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
PMS1-222ENST00000639501 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa24.8■■□□□ 1.56
PMS1-222ENST00000639501 PTPRCP08575 1304 aa24.8■■□□□ 1.56
PMS1-222ENST00000639501 KIAA0232Q92628 1395 aa24.79■■□□□ 1.56
PMS1-222ENST00000639501 CHMLP26374 656 aa24.79■■□□□ 1.56
PMS1-222ENST00000639501 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
PMS1-222ENST00000639501 SLC4A10Q6U841 1118 aa24.79■■□□□ 1.56
PMS1-222ENST00000639501 G2E3Q7L622 706 aa24.79■■□□□ 1.56
PMS1-222ENST00000639501 CNPY2Q9Y2B0 182 aa24.79■■□□□ 1.56
PMS1-222ENST00000639501 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.79■■□□□ 1.56
PMS1-222ENST00000639501 CHL1O00533 1208 aa24.78■■□□□ 1.56
PMS1-222ENST00000639501 CBX1P83916 185 aa24.78■■□□□ 1.56
PMS1-222ENST00000639501 UNC5CLQ8IV45 518 aa24.78■■□□□ 1.56
PMS1-222ENST00000639501 HMMRO75330 724 aa24.78■■□□□ 1.56
PMS1-222ENST00000639501 SLC4A2P04920 1241 aa24.78■■□□□ 1.56
PMS1-222ENST00000639501 ATP2B3Q16720 1220 aa24.78■■□□□ 1.56
PMS1-222ENST00000639501 UVSSAQ2YD98 709 aa24.78■■□□□ 1.56
PMS1-222ENST00000639501 FAM184AQ8NB25 1140 aa24.78■■□□□ 1.56
PMS1-222ENST00000639501 RILPL2Q969X0 211 aa24.78■■□□□ 1.56
PMS1-222ENST00000639501 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
PMS1-222ENST00000639501 MCCP23508 829 aa24.77■■□□□ 1.56
PMS1-222ENST00000639501 SPTLC3Q9NUV7 552 aa24.77■■□□□ 1.56
PMS1-222ENST00000639501 ANAPC15P60006 121 aa24.76■■□□□ 1.55
PMS1-222ENST00000639501 CCDC183Q5T5S1 534 aa24.76■■□□□ 1.55
PMS1-222ENST00000639501 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
PMS1-222ENST00000639501 CPS1P31327 1500 aa24.76■■□□□ 1.55
PMS1-222ENST00000639501 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
PMS1-222ENST00000639501 AATKQ6ZMQ8 1374 aa24.76■■□□□ 1.55
PMS1-222ENST00000639501 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa24.75■■□□□ 1.55
PMS1-222ENST00000639501 MX1P20591 662 aa24.75■■□□□ 1.55
PMS1-222ENST00000639501 AP5Z1O43299 807 aa24.75■■□□□ 1.55
PMS1-222ENST00000639501 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
PMS1-222ENST00000639501 BCL2L12Q9HB09 334 aa24.75■■□□□ 1.55
PMS1-222ENST00000639501 MIS18AQ9NYP9 233 aa24.75■■□□□ 1.55
PMS1-222ENST00000639501 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.75■■□□□ 1.55
PMS1-222ENST00000639501 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa24.74■■□□□ 1.55
PMS1-222ENST00000639501 TMEM87AQ8NBN3 555 aa24.74■■□□□ 1.55
PMS1-222ENST00000639501 KIF3AQ9Y496 699 aa24.73■■□□□ 1.55
PMS1-222ENST00000639501 SULT6B1Q6IMI4 303 aa24.73■■□□□ 1.55
PMS1-222ENST00000639501 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa24.72■■□□□ 1.55
PMS1-222ENST00000639501 KCNF1Q9H3M0 494 aa24.72■■□□□ 1.55
PMS1-222ENST00000639501 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
PMS1-222ENST00000639501 PYCARDQ9ULZ3 195 aa24.72■■□□□ 1.55
PMS1-222ENST00000639501 DTNBO60941 627 aa24.71■■□□□ 1.55
PMS1-222ENST00000639501 LRRCC1Q9C099 1032 aa24.71■■□□□ 1.55
PMS1-222ENST00000639501 KDM4AO75164 1064 aa24.71■■□□□ 1.55
PMS1-222ENST00000639501 PLCB2Q00722 1185 aa24.71■■□□□ 1.55
PMS1-222ENST00000639501 IL17RAQ96F46 866 aa24.71■■□□□ 1.55
PMS1-222ENST00000639501 SSH2Q76I76 1423 aa24.7■■□□□ 1.55
PMS1-222ENST00000639501 COG3Q96JB2 828 aa24.7■■□□□ 1.54
PMS1-222ENST00000639501 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.7■■□□□ 1.54
PMS1-222ENST00000639501 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
PMS1-222ENST00000639501 GIMAP6Q6P9H5 292 aa24.69■■□□□ 1.54
PMS1-222ENST00000639501 FUCA2Q9BTY2 467 aa24.69■■□□□ 1.54
PMS1-222ENST00000639501 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
PMS1-222ENST00000639501 PODXL2Q9NZ53 605 aa24.68■■□□□ 1.54
PMS1-222ENST00000639501 NRKQ7Z2Y5 1582 aa24.68■■□□□ 1.54
PMS1-222ENST00000639501 FIBPO43427 364 aa24.68■■□□□ 1.54
PMS1-222ENST00000639501 GNAI2P04899 355 aa24.68■■□□□ 1.54
PMS1-222ENST00000639501 SPDYE4A6NLX3 237 aa24.67■■□□□ 1.54
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